平茹生产中常见病害有：真菌性病害(木霉、曲霉、青霉、白色石膏状霉、链孢霉)和细菌性病害(细菌斑点病、菌褶滴水病)以及病毒性病害三种。一旦防治不及时，轻者一般减产20％-30％，重者甚至造成绝收。防治措施有： 一、原料的选择与处理 平菇一般采用生料栽培，原料质量的好坏直接关系到栽培的成败。所以选择原料必须新鲜、无霉变、无异味、无虫蛀，并在栽培前放在太阳光下曝晒
2—3天，以杀死原料中的杂菌。栽培时，在1000kg(公斤)培养料中最好加入抑菌药剂克霉灵1kg，生石灰
10—15kg，并将培养料的酸碱度调至8—8．5，以防杂菌侵染。 二、选择菌种 菌种应选择菌丝浓密、洁白、健壮，不带有任何杂菌的菌种，以防发生感染。 三、菇棚严格消毒 使用旧菇棚，要在阳光下曝晒半月进行消毒，然后再用铁锨铲去一层旧土；新建菇棚应在阳光下曝晒一周，并在堆放发菌袋前三天再用10％石灰水喷洒，或配制2％漂白粉溶液喷洒，进行一次消毒，或密闭菇棚用甲醛或硫磺熏蒸进行消毒。消毒后通风换气，以消除药味。 四、加强菇棚通风换气 对菇棚内的空气、温度、湿度应及时加以调控，以保持棚内空气新鲜，保持平菇生产处于适宜的环境下，不给杂菌发生创造机会。 五、防治病害 一旦发生病害应及时将发病菌棒拣出隔离，并采取以下相应防治措施：对真菌性病害，如点片发生木霉、曲霉、青霉时，可将霉点去掉，用石灰或浓石灰水覆盖发病部位；对细菌性病害，如细菌斑点病、菌褶滴水病等应保持菌盖表面不积水，或培养料不过湿，同时降低菇房空气相对湿度至85％以下和喷施
1：600倍氯酸钙溶液。对已感染病毒病的菇棚，应及时在菇类开伞前进行采摘，以防扩散，同时用甲醛对菇棚及使用的各种工具进行消毒，并注意选育抗病毒菌种。
