许多花农一提到病害防治就是“打药”（喷农药）、“打什么药”、“打几盖、打几匙”。然而，药剂防治仅仅是病害防治的措施之一，如果田间操作管理不当，仅靠喷杀菌剂是不能经济有效地控制好病害的。花卉为较高经济价值的作物，其栽培理念也应跟着提升，在综合管理的栽培模式中，病害管理为其中的一环，但却不是独立的一环，不能用只要有病喷药即可的观念来经营管理，只有综合治理才能实现花卉病害的综合防治。
病因
由非生物引起的病害，由于相互不传染，所以称为非传染性病害，又叫生理病害。由真菌、细菌等病原生物引起的病害，是可以传染的，称为传染性病害。
生理性病害的发病原因
温度不适宜、光照不适宜、水分失调、营养条件不适宜、土壤盐分过多、有害气体和物质、土壤酸碱度不适宜等都会影响花卉的正常生长发育，导致病害发生。因此可知生理性病害靠“打药”是不能有效防治的。
传染性病害的发病原因
引起花卉病害的病原生物有真菌、细菌、病毒、线虫、类菌原体、类病毒、寄生性种子植物等。而这些病病原生物对花卉的危害与否及危害的程度取决于病原生物、花卉本身和外界环境条件，由此可知仅靠“打药”也是不能完全控制好传染性病害的。
病原生物、感病性花卉和适宜的环境同时存在时病害才会发生、蔓延；如果大棚中有感病性花卉和病原生物，但没有适合发病的环境条件，病害不会出现。所以病害防治的基本对策就是如何打破这个三角关系，使三者无法同时出现在栽培棚内，如降低病原生物密度甚至完全消灭，种植抗病品种，改变栽培环境等。
田间操作管理对病害防治的影响
大棚管理
炭疽病、细菌性病害等常发生在高温多湿的环境，而灰霉病则发生在冷凉、潮湿的气候下，通风不良的设施栽培，白粉病较易发生。因此栽培棚内温度、相对湿度、通风状况、光照、土壤湿度及PH值等环境因子的调控对病害的防治尤为重要。
经常保持大棚内的通风、透光是抑制病害发生的极为重要的外部条件。即使是严寒的冬季，每天中午也应揭侧膜或开窗，以降低棚内和植株表面的湿度，否则到3月份，便会大面积诱发病害，如香石竹的眼斑病、叶斑病，非洲菊的灰霉病等。
低光照强度导致植株过度生长更易感病，夏季遮荫以防止强光的损伤，但过度遮荫又会使花的枝条较软，光照强度应控制在适宜植株生长发育的程度。
植株管理
移栽、摘心等造成的伤口，均可成为病菌的侵入点，尽可能选择晴天摘心，以利于伤口愈合，防止病原菌的侵入。在进行栽培操作如摘心，扦插时，工具应经常消毒，尽量避免通过手指及工具传播病菌。
合理调节株行距，可有效减少病害的发生。
灌溉管理
滴灌、沟灌或近土面的给水，避免因灌溉水飞溅，将病原菌胞子或细菌带到健株上，才可有效控制病害发生。注意不可让水份滞留在花瓣或叶面，虽为极少许的水分，却是大部份病原菌发芽、侵入植株组织及繁殖不可缺少的重要因子，再者若遇到烈日高温时，也易造成灼伤。
土壤湿度太高会造成土中含水量氧量降低，二氧化碳浓度升高，促进造成根腐之病原菌对根部的危害，而土壤湿度太低，由Rhizoctonia所引起的苗期立枯病较严重。另外，离地栽培也是防止疫病发生的一种栽培方式。
施肥管理
植株生长需要养分，但施用过多的肥料反而对植株造成危害，EC值过高及肥害造成的植株黄化，生长不良等问题也经常可见。肥料种类的选择，需根据花卉种类而异，不同种类的花卉对养分的需求会有差异。植株长势的强弱，也会影响病害发生的机率。
卫生管理
田间卫生可以说是最简单、最有效的防治对策。将病株、病叶、杂草摘除，并带离栽培场加以烧毁，可降低甚至完全清除场内病原菌密度，不能将植物残体堆积于基地某个地方，任其腐烂，因这些残体将成为病菌滋生的温床，靠风力吹送飞溅，增加健株感病的机会。
细菌性病害、病毒病或枯萎病等系统性病害，其病原一旦侵入植株体内，便不易防治，应尽早将感病株全株拔除（连同根圈土壤或基质），并带离栽培场加以烧毁，才可避免病害的蔓延。如果只剪除出现病征部分枝叶，不但无法达到抑制蔓延的目的，病原物可能会由修剪的工具或根对根的接触，传染邻近健康植株，无形中使清除病组织的修剪工作变成病原菌接种工作，反而加速病害的蔓延。再说，干干净净的栽培环境，不但易于管理，且看起来心旷神怡。
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