一、农药混合后发生化学反应致使作物出现药害的农药不能使用波尔多液与石流合剂分别施用，能防治多种病害，但它们混合后很快就发生化学变化，产生黑褐色硫化铜沉淀。这不仅破坏了两种药剂原有的杀菌能力，而且产生的硫化铜会进一步产生铜离子，使植物发生落叶、落果，叶片和果实出现灼伤病斑，或干缩等严重药害现象。因此，这两种农药混用会产生相反的效果，喷过波尔多液的作物一般隔30天左右才能喷石流合剂，否则会产生药害。石流合剂与松脂合剂、有机汞类农药、肥皂或重金属农药等也不能混用。
二、酸碱性农药不能混用。常用农药一般分为酸性、碱性和中性三类。氟铅酸纳、砷酸铅等是中性农药。硫酸铜、氟硅酸纳、白砒、过磷酸钙等为酸性农药。松脂合剂、石流合剂、波尔多液、砷酸铝、肥皂、石灰、石灰氮等为碱性。酸碱性农药混合在一起，就会分解破坏、降低药效、甚至造成药害。大多数有机磷杀虫剂如乐果、杀螟松、马垃硫磷、磷铵等和部分微生物农药如春雷霉素、井岗霉素、灭瘟素等以及猪稻净、代森锌、带森铵等，不能同碱性农药混用。农作物撒施石灰或草木灰后也不能喷洒上述农药。
三、混合后乳剂被破坏的农药不能使用。含钙的农药如砷酸钙、石流合剂、甲基砷酸钙等。一般不能同乳剂农药混用，也不能加入肥皂。因为乳油、肥皂容易同含钙的药剂发生化学作用，产生钙皂沉淀。乳剂被破坏，药效降低，发生药害。
四、杀菌剂农药不能与微生物农药混用。杀菌剂对微生物有直接杀伤作用，若混用微生物即被杀死，微生物农药因而失效。
