农药中毒主要由农田用药导致，常见品种有米乐尔和溴氰菊酯等，这些农药性质比较稳定，因而一旦污染养殖水域，将直接导致鳗鱼中毒。另外，农药对鳗鱼的毒性随水温、水质酸碱性等而异。中毒突发性强，轻度中毒鳗鱼主要表现为体色变浅、活动异常（如蹿游）、鳃丝充血和肌肉痉挛，严重时鳗鱼蹿游严重，体力下降，大量集中到排污箱，体色严重变浅甚至变白，除外部症状外，肝脏外观黄色，肠道轻度发炎。一般首先发生于小规格鳗鱼，主要凭体色改变、活动异常及肌肉痉挛等主要症状及农田用药情况综合判断，农药中毒具显著的时节性，因而及时发现，作出正确判断，将对及时解救起极为重要的指导作用。
有条件者首先改为使用未污染水源，其次对中毒鳗进行解毒，如果无其他水源，应首先关闭污染水源，不再进水。
解毒方法：盐0.3%～0.7%＋碘解磷啶3～5毫克/升或硫酸阿托品20～25片/吨水＋电解维他3毫克/升＋维生素B6 10～15片/立方米，如发现胆囊肿大厉害，应添加消旋山莨菪碱15片/立方米，效果更佳。
内服：每千克饲料拌入板蓝根3克＋穿心莲5克＋甘草3克＋车前草6克＋菌陈6克＋山楂6克＋金银花6克＋鬼针草10～30克＋黄芪8克＋白毛藤6克，连服5～7天。
