农业措施防治
合理轮作换茬
严禁重茬与迎茬。对土传病害（大豆根腐病）和以病残体越冬为主的病害（灰斑病、褐纹病、细菌斑点病等），以及在土壤中越冬的害虫（大豆根潜蝇、二条叶甲、蓟马等），通过3年轮作即可减轻危害。当前推广的麦-麦-豆，麦-豆-杂，麦-杂-豆，以及麦-麦-豆-杂，麦-豆-麦-杂，玉-玉-豆等轮作体系可达到减轻病虫害发生的作用。对发生大豆孢囊线虫病的地区，至少应实行5年以上轮作方可减轻病情。
清除病残体
大豆收割后应清除田间病株残体，并及早翻地，将病残体深埋地下，以加速病原菌消亡，减轻病情。对越冬于土壤中的害虫，通过耕翻将害虫翻到土表，经过耙、压、耢地、机械损伤，加之日晒、风吹、雨淋、天敌食取，可大大增加害虫的死亡率，有效减缓第二年害虫的发生与危害。
选用抗病虫品种
结合本地区自然条件及病虫害种类，选用高产抗病虫品种。要从无病区地块或无病株及虫粒率低的地块留种。
外地调种时，首先要掌握产地的病虫害情况，严格检验有无检疫对象，凡是种子中混杂有菟丝子、野燕麦、菌核等严禁调用或调出作种，尽可能避免从孢囊线虫病较重地区引调种子。
加强栽培管理
播种期过早或播种过深均可加重根腐病发生。一般表土0～5厘米土温基本稳定在6～8℃时即可播种，注意墒情，湿度大时，应晚播而不能顶湿强播。播种深度一般掌握在4～5厘米，如应用播后苗前除草剂时，可适当调整播种深度，因过浅时，易造成药害，但又不能过深。
增施有机肥料，合理施用化肥，N、P、K配比要适当，避免单纯过多施用N肥，防止贪青徒长、倒伏及晚熟，以提高大豆抗病虫能力，使大豆整个生育期间均能健壮发育。
进行至少两次中耕，大豆根腐病重的地块根据苗情及早进行，改善土壤通透性，地温提高，促进新生根大量形成。对连作大豆地，一定要在7月下旬至8月上、中旬中耕培土一次，可以堵塞食心虫羽化，使成虫不能出土或减少出土量或机械杀伤大量的幼虫、蛹、成虫，减轻虫食率。每次中耕前要全面掌握豆田草情、病情、虫情，用以确定配装复式作业。
根据大豆生育期间的实际情况，可采取较灵活的辅助措施，如遇连雨年份就要加强排涝、注意草情，后期出现大草尚需人工除去。
化学除草可以有效清除一些病、虫源，减少中间寄主，尤其可降低田间湿度，通风透光，减轻病情作用较大。
药物措施防治
苗期
药剂拌种可推迟病、虫害的侵染危害，苗期保主根、保幼苗。对大豆根腐病发生较重地区可用50%多菌灵可湿性粉剂加50%福美双可湿性粉剂（3∶2），用药量为种子重的0.5%。对大豆根潜蝇发生较重地区可选用40%乐果或氧化乐果乳油或35%甲诺硫环磷或35%乙基硫环磷乳油，按种子重0.5%播前3～6天内湿拌种。对大豆孢囊线虫病发生重的地区可暂用35%乙基硫环磷或甲基硫环磷乳油，按种子重的0.5%播前3～6天拌种，虽然杀虫率不明显，但对稳产有明显作用。对二条叶甲发生重地区可采用40%乐果乳油，按种子重的0.5%拌种，拌种3～5天内即应播种，以免影响幼苗。
当田间蚜虫、蓟马等害虫发生达到防治指标时，每公顷可用40%乐果或40%氧化乐果乳油750～1500毫升对水喷雾；防治二条叶甲、圆跳虫、黑绒金龟壳甲等害虫每公顷可用拟除虫菊酯类药剂450～750毫升对水喷雾；防治地老虎可制成毒饵诱杀，将90%晶体敌百虫50克用5千克热水溶解，再与炒香饼粉混拌均匀，傍晚用机械或人工撒于豆田垄沟内，公顷豆饼毒饵22.5～37.5千克。
中期
主要防治对象为蚜虫、蓟马、红蜘蛛等刺吸式口器害虫；苜蓿夜蛾、火焰夜蛾、草地螟以及灯蛾、毒蛾类幼虫；灰斑病、褐纹病、霜霉病以及菟丝子。防治蚜虫、蓟马、红蜘蛛等害虫所用药剂与苗期相同。防治苜蓿夜蛾、火焰夜蛾、毒饵类幼虫，每公顷用90%敌百虫或80%敌百虫乳油750～1125毫升对水喷雾。防治大豆灰斑病，每公顷可用80%三乙磷酸铝可湿性粉剂商品量1500～2250克或25%瑞毒霉可湿性粉剂1500～2250克对水喷雾。田间发现有菟丝子，可用48%地乐胺乳油150～200倍液喷雾，并注意清除。
后期
主要防治对象有灰斑病、褐纹病、大豆食心虫等。防治大豆灰斑病、褐纹病，每公顷可用40%灭病威胶悬剂1500克，或50%多菌灵可湿性粉剂，公顷用商品量1800克，或用50%甲基托布津可湿性粉剂、公顷用商品量1800克，对水喷雾。防治大豆食心虫，根据测报，准确防治，一般在成虫发生盛期及幼虫孵化盛期之前施药为宜，每公顷可用2.4%溴氰菊酯（敌杀死）乳油600毫升对水喷雾。
