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综合防治应以小麦高产、高效、优质为中心，根据麦田生态特点和小麦主要病虫害发生规律，按小麦不同生育期，突出重点病虫，兼顾其他，制定分阶段实施的综合防治技术规程，分为播前、播种期、苗期、穗期等阶段进行综合防治。
(1)播种前。本阶段重点是做好小麦品种布局规划和良种检疫调运、调节工作，因地、因病虫制宜，注意在大区内选用不同抗性基因或来源不同抗源的品种进行合理布局，避免品种单一化或抗性基因单一化。
(2)播种阶段。是小麦病虫害防治的基础。多种病虫害发生和这一阶段所采取的措施有关，要以预防病害、防治地下害虫为重点。抓好适期、适量播种，因地、因病虫制宜，搞好种子药剂拌种和种子包衣。
在小麦丛、黄矮病与白粉病以及土传根病混合发生的麦田，可用“三九一一”(75%三九一一乳剂按种子量的0.2%--0.3%)和羟锈宁或粉锈宁(20%粉锈宁或10%羟锈宁)分别按种子量0.1%--0.2%和O.3%混合拌种，还可兼治农田害鼠。
在地下害虫以金针虫为优势种与白粉病和土传根病混合重发的小 麦--玉米、小麦--花生和小麦--水稻等一年两熟地区，用甲基异柳磷按种子量0.1%--0.2%拌种，若与粉锈宁或羟锈宁混合拌种也可兼治病害。
在以蛴螬为主的地区可用辛硫磷铵种子量的0.2%--0.3%与杀菌剂混合拌种。
在仅虫害或病害重的地区单用杀虫剂或杀菌剂拌种防治。
在小麦散黑穗重发区大力提倡粉锈宁或羟锈宁拌种。墒情差的情况下，粉锈宁或羟锈宁以有效低量拌种，同时增加拌种量的10%--15%。
还可用增产菌每667平方米10--15克拌种，也可与杀虫、杀菌剂混合拌种，达到增产与灭害效果。
(3)小麦返青到拔节期。这一生育期的主要病虫害有麦红蜘蛛、金针虫、纹枯病、全蚀病等。防治指标：麦红蜘蛛6头/厘米单行，金针虫枯心苗率3%，纹枯病病株率10%应用药防治。
(4)抽穗至灌浆期。此期主要病虫害是麦蚜、一代粘虫、条、叶锈病、白粉病、吸浆虫等。这些病虫害多在4月中、下旬至5月上旬初进入迅速增殖期，正值小麦受害的敏感期，也是自然天敌控制害虫的重要时期，应以保护利用天敌为中心，协调生防与化防的矛盾，推广农药混配1次性施药，控制病虫为害。
在麦蚜、白粉病和锈病重发生地块，可667平方米用20%粉锈宁50--60克与50%辟蚜雾68克或40%氧化乐果10毫升混合常规喷雾。
在吸浆虫和病害重发地块，可用粉犭宁与20%林丹乳油100毫升混合，1次性常规喷雾，可兼治多种病虫。
