许多大蒜种植区，对大蒜的病、虫害防治不够重视，往往生产出病斑蒜，小瓣蒜，导致产量降低，更达不到上市或出口蒜头的标准。
农业防治选用优良品种和脱毒种，选用瓣大、无虫无病斑的蒜辫作种用，并在播种前一天用50%扑海因1500倍液浸种5小时，晾干待播。
增施有机肥。亩施5000公斤以上优质腐熟有机肥，并配施普钙50公斤，硫酸钾15公斤、尿素10公斤，精细整地，施用3%辛硫磷颗粒剂2公斤/亩或2.5%虱螟灵可湿性粉剂3～5公斤/亩。
科学追肥，适时灌水。大蒜烂母期及时追肥并浇水，亩追施腐熟饼肥200公斤左右或绿发生物蔬菜专用肥50公斤。花茎抽出前10～15天及时浇水追肥，以硫铵20～25公斤为宜，连追2次。鳞茎膨大期适当追肥15～20公斤，但须适当控制浇水。
适时喷施微肥或激素，提高植株抗性。在大蒜9叶和12叶期各喷1次赤霉素20×10E-6，可提高大蒜产量25%；各喷1次0.11%叶面宝或0.1%稀土，可分别提高产量22.6%和19.6%，并可显著减轻病毒病的发生，提高植株抗逆能力。
虫害防治主要以葱蝇、种蝇、韭蛆为主，另有叶部蓟马、蚜虫等。4月中旬左右幼虫危害期用40%甲基异硫磷1000倍液灌根，杀死蛀入基秆组织内的幼虫；成虫孵化盛期每隔10天喷30%敌氧菊酯1000倍液；喷洒植株叶面及地表、植株周围土隙中的地上蓟马，根据发生情况和发生量采用40%菊马乳油800倍液进行喷杀，每5～7天1次。
病害防治主要以大蒜叶枯病和病毒病、锈病为主。在病害发生初期，采用复配用药、进行主治和兼治防治等措施，把病害控制在初发阶段。选用农药有50%扑海因800倍液、64%杀毒矾500倍液等药剂轮换复配应用。
