病毒病是小西葫芦的主要病害，又称花叶病。分布广泛，各地都普遍发生，保护地、露地种植都可受害，一般发病率10％一15％，严重时病株达20％一30％，常造成3―4成减产，其果实质量低劣，致小西葫芦提早拉秧甚至毁种。此病除为害小西葫芦外，还可为害西葫芦、黄瓜、冬瓜、甜瓜等瓜类蔬菜。
[症状]该病从幼苗至成株均可发生。主要有花叶型、黄化皱缩型及两者混合型。花叶型表现嫩叶明脉及褪绿斑点，后呈淡而不均匀的小花叶斑驳，严重时顶叶变为鸡爪状，染病早的植株可引起全株萎蔫。黄化皱缩型表现植株上部叶片沿叶脉失绿，叶面出现浓绿色隆起皱纹，继而叶片黄化，皱缩下卷，叶片变小或出现蕨叶、裂片、植株矮化，病株后期扭曲畸形，果实小，果面出现花斑，或产生凹凸不平的瘤状物，严重时植株枯死。
[发病规律]病毒可在保护地瓜类、茄果类及其他多种蔬菜和杂草上越冬。第二年通过蚜虫传播，也可通过农事操作接触传播，种子本身也可带毒。高温干旱有利于病毒病发生，小西葫芦生长期管理粗放，缺水缺肥，光照很强，蚜虫数量多等情况下病害发生严重。
[防治方法]1．选择抗病良种，可选用矮生早熟品种、花叶型品种。目前长蔓西葫芦、阿太一代、早青l号等品种相对较抗病。2.进行种子消毒，播种前用10％磷酸三钠浸种20分钟，然后洗净催芽播种。也可用55℃温水浸种40分钟，或干种子70℃热处理3天。3．施足底肥，适时追肥，前期少浇水，多中耕，促进根系生长发育。及时防治蚜虫，早期病苗尽早拔除，中后期注意适时浇水、施肥，加强田间管理。4．药剂防治。发病初期可用20％病毒A可湿性粉剂500倍液，或1．5％植病灵乳剂l000倍液，或NS83增抗液100倍液，或抗毒剂1号250倍液喷洒叶面，每10天1次，连续喷施2―3次。
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