小型西瓜品种相对大西瓜品种具有较强的抗病性，一般病害为蔓枯病、枯萎病、病毒病、炭疽病等，病虫害防治最好7－10天进行一次。
蔓枯病真菌性病害，俗称烂头病，常在根头或茎节部发生，初期呈水浸状，后分泌红褐色脂状物，防治： 轮作； 选抗病品种； 种子消毒； 施足优质有机肥及适量氮磷钾肥； 采用高畦覆膜栽培； 合理灌水； 适度整枝，保留瓜蔓基部叶片； 坐瓜期增施磷钾肥，控制氮肥； 药剂灌根、喷洒或涂茎相结合，可用70％甲基托布津加10倍水徐根或60％速克灵
15o0倍液加4000倍农用链霉素喷叶。
枯萎病又称蔓割病、败根病，多在结果期发生，蔓梢失水枯死，部分细根腐烂，根皮剥落，地面上茎部有纵裂并分泌褐色脂状物，维管束变褐色。防治： 选择抗病品种； 轮作； 嫁接。
病毒病叶面凸凹不乎，呈透明斑，叶片卷曲，黄化发脆，茎节缩短、扭曲。高温、干旱、强光是主要发病条件，病毒主要靠芽虫、蓟马等接触性传染。防治：防治蚜虫、蓟马，拔除田间病株，消除周围杂草；用20％病毒A500倍液或1．5%植病灵乳油8001000倍液喷洒。
炭谊病常从植株基部叶片开始发病，呈同心抡纹状，茎部、果面生椭圆形及线状褐色凹陷病斑。防治：用64%杀毒矾400倍液喷洒。
