茄子萎蔫的主因有疫病、菌核病、茎基腐病、青枯病、黄萎病、根结线虫病、肥害等。具体诊断如下：
1、看田间分布。当发生肥害后，一般会出现晴天中午萎蔫，傍晚恢复正常，严重的可造成植株死亡。而以上其它病害，其田间分布形状为点片分布。
2、看根部是否有根结。发生根结线虫病，根部可见大小不等的根结。而以上其它病害则没有根结。
3、看维管束是否变褐。茄子黄萎病和细菌性青枯病的维管束都变褐，以上其它病害无此症状。这两种病害在苗期不表现症状，在开花结果后开始表现。但黄萎病从下往上，病茎杆维管束呈黄褐色，潮湿时，茎基产生白色霉状物，在叶缘和叶脉间出现不规则的淡黄色斑块，近主脉处仍保持绿色，呈褐色掌状斑驳，后发病部位枯死，呈花皮状，且有时会出现“半边疯”的现象。而细菌性青枯病的病茎中、下部皮层粗糙，常长出长短不一的疣状突起和不定根，有时在病茎上发生油渍状褐色不规则斑状。如将病茎做横切面检查，略加挤压，有乳白色黏液溢出(菌脓)。
4、看根部是否腐烂。茄子根腐病的根部或根茎部，表皮呈褐色腐烂，且易剥开，致木质部外露，以上其它病害无此症状。
5、看茎基部和分叉处是否腐烂。茎基腐病只为害茎基部，多数在土表上下3－5厘米处产生水渍状暗色病斑，并迅速向周围扩展，手捏发软，叶片自下而上变黄，后萎蔫。病斑绕茎1周后，植株迅速青枯死亡，地下部分多表现正常。菌核病多从茎部分叉处染病，灰白色，稍凹陷，韧皮部腐烂，且其菌丝体可侵入病茎内，后期表皮纵裂，病斑大小、形状、长短不等，边缘水渍状，表面和病茎内均着生白色棉絮状菌丝及黑色菌核，病部以上萎蔫枯死；在植株上部发病，可形成“折弯”的症状。疫病多从茎基和分枝处发病，初呈水渍状，很快环绕枝条和茎基，变为褐色或黑褐色斑，并上下蔓延，边缘不明显，稍凹陷。
细菌性青枯病：发病初期用72％农用链霉素2000倍灌根，另外用敌克松400倍喷洒。
黄萎病：定植缓苗后用70％红日可湿性粉剂400液灌根，每株用药液0.3公斤，每7－10天1次，连灌2－3次。发病初期用70％红日可湿性粉剂800倍进行土壤消毒或灌根，每株用药1000毫升，每10天1次，连灌2－3次。
疫病：发病初期可喷洒70％红日可湿性粉剂(甲基硫菌灵)800倍，50％用功悬浮剂500倍液。每隔7天喷1次，连喷2－4次。
茎基腐病：初发病时喷洒20％甲基立枯磷乳油1200倍液，主要喷洒植株茎基部。也可在病部涂五氯硝基苯粉剂200倍液加50％福美双可湿性粉剂200倍液，效果较好。
根结线虫病：可在播种或定植前15天，选用10％克线磷、50％益舒宁、3％米乐尔等颗粒剂，拌均匀，撒施后再耕翻入土，每亩用药量3－5公斤。定植后，在棚室内植株局部受害，可用50％辛硫磷乳油1500倍，或80％敌敌畏乳油1000倍液，每株灌药液0.25－0.5公斤，以熏杀土壤中的根结线虫。
肥害：发生肥害时，要适时灌水，及时喷施0.01％天丰素乳油3000－4000倍，可有效缓解肥害。
菌核病：在发病初期用70％红日可湿性粉剂800倍液叶面喷雾进行防治，每周1次，连喷3次即可。
