对大蒜软腐病,应坚持综合防治的原则。宜选择地势平坦、排灌方便，土壤有机质丰富、保肥水能力强，而且前茬为非葱蒜类土壤种植大蒜。施足腐熟的以磷钾肥为主的优质有机肥、饼肥，促进幼苗健壮生长，提高植株的抗病能力，以减少生理性病害的发生。
土壤处理：对已发生软腐病的地块，可用77%多宁可湿性粉剂600倍液喷洒播种沟，每亩喷药液100公斤，喷后即播种，或用硫酸铜、生石灰、草木灰以1∶1∶100的比例混合，撒施于播种沟内。
药剂防治：可在发病前或发病初期，每亩用72%农用链霉素3000～4000倍液，或47%加瑞农750倍液，或50%代森铵1000倍液等50公斤喷雾，每隔5～7天喷1次，视病情连续防治2～3次。
对发病轻的病株及其周围的植株重点喷雾，注意喷到植株茎基部；重病株拔除销毁。如采用以上措施后仍出现病株，可及时用72%农用链霉素可湿性粉剂400倍液，或77%可杀得可湿性粉剂500～800倍液喷雾，每亩50公斤，每隔7～10天喷1次，连喷2～3次。也可用新植霉素3000～4000倍液，或50%多菌灵、75%百菌清可湿性粉剂500～800倍液，或50%甲基托布津可湿性粉剂600～1000倍液灌淋根茎。
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