南瓜主要病害，它们分别为南瓜疫病、南瓜白粉病和南瓜病毒病。
疫病
在南瓜生产上，疫病是最重要的病害之一，在各南瓜产区均有发生。疫病严重时瓜秧大面积枯死，果实腐烂，甚至绝产。
症状南瓜疫病在整个生育期都可发生。幼苗发病，茎基部出现水渍状软腐，多呈暗绿色，常造成幼苗倒伏。成株期发病，叶片上产生暗绿色圆形病斑，边缘不明显，空气潮湿时，病斑迅速扩展，叶片部分或大部分软腐，在病部可看到白露。南瓜为匍匐茎，接触地面广，茎部各部位可发生褐色软腐状不规则斑，湿度大时，病部也产生白色霉层。若果实被害，初呈暗绿色水浸状小点，迅速扩展至全果实腐烂，果实上常密生灰白色霉状物。
防治方法1.药剂防治。雨季到来前用缓释剂1号或2号施于茎基部2厘米深处，覆土即可。或用缓释颗粒剂撒于南瓜植株周围。土壤湿度小，缓释剂贮存于田间；土壤湿度大，疫病要发生，缓释剂药量则缓慢释放，起到防治病害的目的。亦可用质量分数为25%甲霜灵可湿性粉剂或质量分数为72%克露可湿性粉剂加500倍土，配成药土。每公顷用配好的药土1500公斤，在雨季到来前撒于瓜根周围。也可在病害发生初期喷洒质量分数为25%甲霜灵的600倍液，控制病害蔓延。
2.控制发病中心。搞好田间调查，发现中心病株，及时彻底剪除，并在发病中心周围喷洒或撒施上述药剂。
3.处理病残体。土壤及落入土壤的病残体是主要初浸染源。除对土壤采取措施外，病株、病瓜及其他病残体，不可随地丢弃，更不可留在田间，应收集起来，高温积肥、隔年施用，或烧毁、深埋。
白粉病
白粉病俗称“白毛”，是南瓜生产中的重要病害之一。除危害南瓜外，也是黄瓜、西葫芦、甜瓜、冬瓜等多种葫芦科蔬菜的重要病害。
症状白粉病主要发生在南瓜生长的中后期。病菌主要侵害叶片，其次是茎和叶柄，一般不危害瓜。发病初期，首先在叶片的正面和背面长出圆形白色小粉点，逐渐扩大，白粉也越来越密厚，不久连成片，成为边缘不清楚的粉白斑。发病后期布满整个叶片，以后呈灰白色，叶片逐渐变黄、发脆，最后叶片失去光合功能（一般不落叶）。茎和叶柄发病，症状与叶片相似，但不及叶片明显。
防治方法1.药剂防治。发病初期及时喷药，应着重叶背喷药。常用药剂有：质量分数为50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，质量分数为15%粉锈宁可湿性粉剂1500倍液，质量分数为20%粉锈宁乳油2000倍液，质量分数为50%硫悬浮剂200～300倍液，石灰硫磺合剂0.1～0.2度，质量分数为75%百菌清可湿性粉剂600倍液，质量分数为50%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，质量分数为50%代森铵1000倍液，农抗“120”或“BO-10”200倍液。7～10天喷1次，连续喷2～3次。
2.物理防治法。用质量分数27%高脂膜乳剂80～100倍液，在发病初期喷洒在叶片上，使之形成一层薄膜，不仅防止病菌浸入，还可造成缺氧条件，使白粉病死亡。一般隔5～6天喷1次，连续3～4次。
病毒病
各种类型南瓜病毒病都比较严重，尤其是无杈南瓜和美洲南瓜发病最普遍。
症状瓜类病毒病因种类不同，表现的症状也各有差异，主要有花叶型、皱缩型、绿斑型和黄化型等。病毒病中，复合浸染发生频繁，症状表现更为复杂，而且发病重，以皱缩型较为常见。一般症状表现比其他类型明显，新生出的叶片沿叶脉出现浓绿色隆起皱纹，或出现沿叶脉坏死、蕨叶、裂片，叶变小，呈鸡爪叶（畸型）。叶及果面都可能出现花斑。果实多为畸形，或产生凹凸不平的瘤状物，严重时植株死亡。
防治方法1.防治蚜虫。蚜虫是传播病毒病的主要媒介，但蚜虫多着生在心叶及背皱缩处，难以喷杀。所以，防治蚜虫一是要早，在有翅蚜迁飞前喷洒药剂，也就是打“窝子蜜”。二是喷洒药剂均匀细致。三是尽量选择兼有触杀、内吸、熏蒸三重作用的药剂。也可用银灰膜条驱蚜，以避免其他有翅蚜迁入瓜田。
2.拔除病株。在田间操作，如整枝、压蔓、摘心、授粉时，发现病株，应立即拔除、烧毁或深埋，以免传播。在有条件的地方，检查地块时集中拔除。统一处理病株后，用肥皂洗手，然后再进行其他田间管理工作，预防人为传播。
3.化学及生物制剂防治。发病初期，喷洒质量分数为20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或质量分数为1.5%植病灵乳剂1000倍液，或菌毒清200～500倍液。
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