茭白主要的病虫害有二化螟、大螟、长绿飞虱和纹枯病、锈病等，防治方法目前主要为化学防治。二化螟蛀食茭白叶鞘、茎部和果肉，是茭白上为害最重的害虫，造成产量损失达20%以上。但目前在茭白螟虫的防治的施药频次高，用药量大，一季茭白甚至施药十次以上。在禁止使用高毒和剧毒农药前，茭农主要使用甲胺磷和呋喃丹等剧毒农药防治螟虫等害虫，使茭白中的农药残留大大超标，严重威胁消费者的生命安全。2000年浙江省农药鉴定管理所采用农业部农药鉴定所推荐的农药残留检测方法，共抽样检测了24个茭白样品，结果发现有16个样品超标，占76.2%，表明我省茭白产品农药残留问题十分严重。自2002年7月1日起，浙江省人民政府发布了《关于禁止销售和使用甲胺磷高毒高残留农药的通告》，在全省范围内禁止销售并在各类作物上禁止使用甲胺磷农药及其混配制剂，尤其在水稻等水田作物上禁止使用所有拟除虫菊酯类杀虫剂及其复配产品，在蔬菜、水果、茶叶和叶草药材的生产过程中全面禁止使用甲胺磷、呋喃丹、氧化乐果、甲基对硫磷等农药。因此，推广和使用高效低毒低残留新农药和使用其他防治方法来替代上述化学农药是当务之急。由于目前茭白种植类型的变化，茭白病虫害的发生情况有所变化。高山茭白（在海拔600米以上）和冷水茭白（用水库水灌溉）由于湿度大，气温适宜，病害尤其是茭白锈病的发生特别严重，而二化螟则相对较轻。大棚和小拱棚培育茭白由于棚内湿度高，茭苗易受病害危害，因此要注意通风和防病。但应当注意的是，茭白是受黑粉菌侵染而肉质茎膨大，使用杀菌剂容易抑制黑粉菌而产生不孕的“假性雄茭”，因此在茭白孕茭期慎用粉锈宁、三唑酮、腈菌唑等杀菌剂。除了利用生物农药来逐步替代化学合成农药外，结合使用生物防治、物理防治和农业防治来综合治理病虫害是非常必要的。嘉兴新篁茭白区曾经试验利用频振式杀虫灯及套养红鲤鱼模式，即在每20～40亩茭白田边砌一个10～20平方米的鱼池，鱼池与茭白田有沟相连，池边装一个频振式杀虫灯，杀虫灯诱杀螟虫等茭白主要害虫并落入池中作为池中和田中鱼的食料，通过这一模式大大减少了杀虫剂的使用量。缙云高山茭白和武义冷水茭白则使用茭白田套养红鲤鱼除草和除虫的生产模式。余姚河姆渡目前正在尝试生物农药+鸭子除虫和除草的生产模式，即每亩茭白田放养12～15羽鸭子，使用安全的生物农药和禁用化学农药，取得了较好的经济和生态效益。将不同的物理、生物和栽培方法有机地结合使用，可以有效地控制茭白病虫害的发生，同时可大大减少化学农药的使用量和使用次数，这将是当前和今后无公害和绿色茭白生产的新途径。
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