常见的幼苗侵染性病害有猝倒病、立枯病、叶斑病、炭疽病等。这些病往往会在短期内造成苗木大量死亡，给苗农带来很大损失。现介绍几种综合防治措施。
一、选好圃地。应选水源较好而地势较高的轻粘壤土或沙壤土作圃地，坚持轮作制，不在同一块圃地连续培育同一种苗木，苗圃土壤要事先消毒。①福尔马林消毒。每平方米苗圃用福尔马林50毫升加水10公斤均匀喷洒地表，然后用塑料薄膜或草袋覆盖，闷10天左右揭开覆盖物，使气体挥发，两天后可播种。②多菌灵消毒。用50%的可湿性粉剂，每平方米拌1.5克。也可按1:20的比例配制成药土撒在苗床上，均能有效防治苗期病害。③五氯硝基苯消毒。每平方米苗圃地用75%五氯硝基苯4克、代森锌5克，混合后再与12公斤细土拌匀，播种时下垫上盖，对炭疽病、立枯病、猝倒病、菌核病等有特效。④硫酸亚铁消毒。用3%的硫酸亚铁溶液处理土壤，每平方米用药液0.5公斤，可防治针叶花木的苗枯病，桃、梅的缩叶病，兼治花卉缺铁引起的黄化病。圃地最好冬季深翻，第二年播种时浅翻一次。
二、种子消毒。播前应精选种子，淘汰病、弱种子,用0.3%~0.5%的高锰酸钾溶液浸种0.5~1小时或将种子用50℃温水浸种24小时，然后将下沉的种子取出用0.2%的福尔马林溶液浸种30分钟，取出后再闷2小时。也可用0.5%~1%硫酸铜溶液浸种1~2小时，然后捞起种子用清水冲净药液，阴干后适时播种。播种时注意深度，盖土不宜过厚，以便种子萌发出苗。
三、药剂治疗。从出苗期开始，每隔7~10天每亩苗床用0.5%~1%的波尔多液50~75公斤喷洒林木幼苗，使幼苗外部形成保护膜，防止病菌侵入。同时，要把好施肥关，肥料应以施农家肥为主，化肥为辅。垃圾肥、堆肥和厩肥可能带病菌，应堆置发酵腐熟后才能使用。发病后，及时清除病苗，在病苗穴周围撤石灰粉，以防止蔓延。并每隔10~15天施药1次，可每亩用敌克松500~800倍液100公斤，或65%的代森锌300~800倍液100公斤喷雾，也可用1:100的甲基硫化砷药土150公斤，或8:2的草木灰石灰粉混合后适量撒施于苗床上进行治疗。
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