酵素菌秸秆堆肥是用酵素菌堆制发酵的农作物秸秆，由微生物产生多种酶，促进有机物水解，使发酵物分解转化为可供植物生长的营养物质的有机肥料。
一、材料准备。每1000公斤作物秸秆需要酵素菌1公斤-2公斤，尿素5公斤（可用10%的人粪尿、鸡粪或是30%土杂肥代替），麦麸5公斤，过磷酸钙5公斤。
二、材料处理。玉米秸、高粱秸最好铡成20-30厘米的小段（如堆制时间长可整条秸秆堆沤），矮秸秆作物如麦秆、豆秆等可以不铡段。
三、堆制要点：吃饱、喝足、盖严。所谓吃饱是指秸秆和调节碳氮比的尿素或土杂肥及麦麸要按所需求的量加足，以保证堆肥质量。喝足就是秸秆必须被水浸透，加足水是堆肥的关键。盖严就是成堆后用泥土密封，可起到保温保水作用。堆制10-15天可翻堆1次并酌情补水，加速成肥过程。如不进行翻堆，要在中央竖数把秸秆束，便于透气，满足好气性微生物活动。
四、堆制方法
1、集中堆制。①选择背风向阳的地方建堆，以利增温。②堆制场地四周起土埂30厘米，堆底要求平而实，以防跑水。③将已湿透的秸秆撒于堆处，堆高60厘米时浇足水，料面先撒尿素、磷肥总量的2/10，再加少量水溶解，然后撒扩大菌和麦麸混合总量的2/10，再撒秸秆高60厘米，按上述方法分别撒化肥和麦麸扩大菌的4/10，上面再撒秸秆30-40厘米厚及其余的化肥和菌，最后用泥封存1.5-2厘米。要求堆宽1.5米-2米，高1.5米-1.6米，长度不限。分3-4层堆沤。稻秆、麦秆、豆秆纤维长的材料不可踩实，玉米秆应适当踩实，但不可太实，否则影响发酵。
2、深埋堆沤。在果园行间挖宽50-60厘米，深1米的条沟，在沟内按上述堆制方法进行堆沤，成肥可直接供果树利用。
3、温室底施。在室内挖深1米，宽40-50厘米的定植沟，在沟内撒30-40厘米秸秆进行堆制，堆制方法同上。最上面盖足土施肥后直接定植。秸秆应铡成20-30厘米的小段。
五、堆肥检验标准。成肥颜色以黄褐色最佳，无气味或有点霉味和发酵味最优，纤维变脆，轻压便碎。
