辣椒为吸肥量较多的蔬菜类型，每生产1000kg约需氮5．19kg、五氧化二磷1．07kg、氧化钾6．46kg。施肥上要注意如下几点：
1营养土配制育苗床土要肥沃、疏松通气，土壤孔隙度60％以上，容重小于或等于1，速效氮50～100mg／kg，速效磷50mg／kg，并含丰富的钾最好。如用多年的菜园土做苗床土，要进行消毒，否则苗期会发生猝倒病、立枯病等多种苗期病害。如用大田土壤，以砂壤土为好。按比例加入有机肥、化肥，有机肥有大粪干、猪粪、马粪、草炭、炕土等，最好用经冬天冻结的草炭。幼苗床土配制，用腐熟草炭5份，腐熟马粪或猪粪渣3份，田土2份；或腐熟马粪5份，腐熟大粪干2份，田土3份。土壤酸度较高时可加入适量石灰，粘重时可加入适量的细砂。假植床土配制，用1／2的田土，1／4草炭，1／4腐熟马粪或猪粪渣混合而成，并在每m3营养土中加入3kg速效化肥。
2苗期追肥苗床施肥以基肥为主，控制追肥，在假植之前一般不追肥。当幼苗开展1～2片真叶后，如床土不够肥沃，秧苗表现缺肥时，可追施10％的充分腐熟的人粪尿水，或0．1％的尿素，配合施用少量的磷钾肥。床土肥沃的可少施或不施追肥，浓度不宜过大，否则易伤根，甚至引起落叶。追肥应在晴天中午前后进行，追肥后随即用清水将沾在叶片上的粪水冲洗掉。带水施肥后，应使幼苗叶片上水珠干后方可闭棚。
3土壤选择辣椒对土壤条件要求较高，粘质土壤保水、保肥能力强，但排水及透气性差，辣椒定植后前期地温上升慢，缓苗延迟，但有后劲；砂质土排水及透气性好，定植后地温提高快，发棵早，但保肥能力差，后期易早衰；砂壤土的保肥、保水及透气性均较好，最适于辣椒生长。土壤酸碱度以 pH6．2～7．2为宜。
4大田基肥基肥以有机肥为主。常用的有机肥有厩肥、炕土、猪粪、塘泥、人粪尿、饼肥等，667m2用腐熟有机肥3000～5000kg，过磷酸钙50～80kg，饼肥50～100kg，2／3铺施，1／3施入定植沟内。大棚栽培施基肥量要大，一般每667m2 施入优质农家肥7500kg，饼肥300kg，过磷酸钙60kg，碳酸氢铵50kg。
5追肥包括露地栽培和早春大棚栽培的两种追肥方法
①露地栽培追肥方法 生长前期，每隔5～6d浇一次小水，随水冲入少量的粪稀。到7月份后，以化肥为主，分3次追施化肥，门椒收获后，结合培土第一次追肥，每667m2施尿素10～15kg，对椒迅速膨大时第二次追肥，施尿素10～15kg，在第三层果迅速膨大时第三次追肥，每667m2施尿素 20～25kg。过了8月份，可浇水时随水冲施粪稀，追施化肥以穴施为主，将肥料埋入土下，根际5～10cm处，如果施肥时土不是很干，可先不浇水，过两天后再浇水。
②早春大棚栽培追肥方法定植时浇水不要太大，浇定植水后要及时中耕松土，中耕后要适当蹲苗，控制肥水，防止植株徒长，造成落花落果。当门椒果实达到2～3cm大时，及时浇水追肥，每667m2施腐熟人粪尿500～1000kg或15～25kg硫酸铵，施完肥后及时中耕。门椒采收，对椒长到2～3cm大时，施硫酸铵10kg，硫酸钾10kg，也可喷施过磷酸钙浸出液。第三层果实已经膨大，第四层果已经坐往，进入采收高峰时应加大追肥量，每667m2施硫酸铵20kg，硫酸钾10kg，结果后期再追肥浇水2～3次。前期追肥，可穴施，也可撒施，注意离根系远点。后期追肥随水浇施。
6二氧化碳施肥施用二氧化碳，落花落果减少，座果率提高，植株分枝能力增加，株形扩展，花蕾发生量增多，使结果数大大增加。且单果品质提高，相同大小单果重量增幅达10％左右。棚栽辣椒施用二氧化碳肥从初花期始连续用15d以上为宜，浓度以晴天750mg／L，阴天550mg／L 较好。
7微量元素的使用一般有机肥充足，不会产生微量元素缺乏症状。钙可延缓辣椒的衰老，增强抗性，而缺钙使辣椒植株生长迟缓，果实易得脐腐病。一般酸性土容易缺钙，可667m2施50～70kg石灰，还可起到改良土壤，中和酸性，释放土壤潜在养分的作用。
进入果实采收盛期，镁吸收量增加，如果镁不足，表现缺镁症状，叶片灰绿，叶脉间黄化，下部叶片脱落严重，植株矮小，坐果率低。可用1％～3％的硫酸镁或1％的硝酸镁，每667m2喷施肥液50kg左右，连喷几次。
缺硼，花药细胞分裂不正常，花粉发育不良，花粉萌发和花粉管生长受到显著抑制，酚类化合物大量积累，使根尖或茎端分生组织受害或死亡。可用0．1％～0．25％的硼砂或硼酸溶液喷施，每次每667m240～80kg溶液，6～7d一次，连喷2～3次。
