微量元素包括锌、硼、钼、锰、铁、铜六元素。都是作物生长发育必需的，仅仅是因为作物对这些元素需要量极小，所以称为微量元素。在20世纪50～60年代以施用有机肥为主，化肥为辅的情况下，微量元素缺乏并不突出，随着大量元素肥料施用量成倍增长，作物产量大幅度提高，加之有机肥料投入比重下降，土壤缺乏微量元素状况也随之加剧。但是不同土壤质地，不同作物对微量元素的需求存在差异，应根据土壤微量元素有效含量确定其丰缺情况，做到缺素补素。一般情况下，在土壤微量元素有效含量低时易产生缺素症，所补给的微量元素才能达到增产效果（表1）。
表1 土壤微量元素有效含量丰缺指标
|
微量元素 |
分级 | ||||
|
很低 |
低 |
中 |
高 |
很高 | |
|
（mg/kg） |
（mg/kg） |
（mg/kg） |
（mg/kg） |
（mg/kg） | |
|
锌（Zn） |
＜0.5 |
0.5～1.0 |
1.1～2.0 |
2.1～4.0 |
＞4.0 |
|
硼（B） |
＜0.25 |
0.25～0.5 |
0.51～1.0 |
1.1～2.0 |
＞2.0 |
|
钼（Mo） |
＜0.1 |
0.1～0.15 |
0.16～0.2 |
0.21～0.3 |
＞0.3 |
|
锰（Mn） |
＜5 |
5.0～10.0 |
10.1～20 |
20.1～30.0 |
＞30 |
|
铁（Fe） |
＜2.5 |
2.5～4.5 |
4.5～10 |
10～20 |
＞20 |
|
铜（Cu） |
＜0.1 |
0.1～0.2 |
0.2～1.0 |
1.1～2.0 |
＞2.0 |
微量营养元素在作物体内多数是酶、辅酶的组成成分或活化剂，对叶绿素和蛋白质的合成、光合作用或代谢过程，以及对氮、磷、钾等养分的吸收和利用等均起着重要的促进和调节作用。作物对微量元素的需要量虽少，但在缺素或潜在缺素土壤上施用相应的微肥，可大幅度提高作物的产量和改善农产品的品质。试验证明，钼肥对豆科作物，硼肥对甜菜、油菜、棉花和苹果、柑橘、杨梅等果树作物，锌肥对水稻、玉米、果树、蔬菜，锰肥对小麦、烟草、麻类等作物，铜肥对小麦、水稻等作物，都有增产作用，一般增产10％左右。在严重缺素的土壤上，施用相应的微肥甚至可成倍增产。在微量元素缺乏的土壤上施用微肥，除提高产量外，还有改善产品品质的作用。此外，施用微肥还能增加作物对病害、低温、高温和干旱等的抗性，但土壤中微量元素含量过高或微肥施用过量，均可严重降低作物的产量和品质。
