杂交蔬菜不能留种目前生产上使用的杂交蔬菜种子很多，通过有性杂交所产生的后代，往往比它们双亲的性状更优越，即杂种优势。如大白菜、甘蓝、洋葱、辣椒、黄瓜、萝卜、西瓜、胡萝卜、番茄、茄子等。利用杂交一代种子，具有显著的增产优势，同时还有早熟、优质等其他经济性状，在生产上发挥了重要作用。但是杂交蔬菜不能留种，这是因为杂种从第二代上开始，便产生分离现象，生长不一致，优势减退，产量降低。因此，生产上蔬菜杂交种只能应用一年，不能继续留种。
用激素催熟的水稻不宜留种目前，不少地方为了提高土地利用率，提早腾茬种秋冬播作物，利用植物生长调节剂如“九二0”、乙烯利等激素喷施水稻，以达到提早成熟和早收割的目的。在杂交稻制种上，曾发现过使用“九二0”等激素类物质不当，对杂交稻种子的发芽率等有影响的介绍。用乙烯利催熟水稻，对种子发芽率、发芽势有无影响，以及乙烯利处理后是否会引起稻种变异，虽然科研人员未做过相关的试验，但在不清楚乙烯利在处理对稻种可能产生哪些负面影响的情况下，最好不要将经过乙烯利催熟的水稻留作种用，以免造成不必要的损失。
杂交棉是否可以留种以前，湖南棉区曾有过在杂交棉种子供不应求的情况下，用湘杂棉2号杂交2代（F2）做过种子的事例。但随着制种技术的提高，在杂交棉1代种子满足供应的情况下，目前最好不要再使用杂交棉2代（F2）种子了。这是因为棉花是异交作物，田间异交率在7%~9%之间，杂交二代棉种其丰产性能和抗性当然差于一代，因此，不宜提倡使用。另外，对常规棉而言，伏前桃和晚秋桃，剥桃花的棉子均不宜留种；喷过乙烯利的棉子发育不全，不能做种；在水泥场上晒过的棉子，机械损伤过重的棉子也不宜留种；贮存时间过久的棉子及与农药、化肥一起存放的棉子，其发芽率锐减，不得当种用；有些棉农多年没有更换新品种，品种纯度只有70%~80%左右，品质严重退化，继续使用必将导致减产，品质下降，不宜留种。
