瓶栽是金针菇工厂化、自动化生产的主要方式，现介绍生产程序。
1.设备要求进行工厂化周年瓶栽金针菇，必须建造培养基装瓶室、灭菌室、冷却室、接种室、菌丝培养室、搔菌室、催菇室、抑制室、套纸筒生长室，以及分级包装室、废培养基清除室等。
1.1接种室必须设置翅片冷却器，将培养温度降到15～18℃。
1.2菌丝培养室室内温度保持在18～20℃，同时必须安装带定时的换气阀或全热交换器，2～3小时强制通风15分钟，排出二氧化碳。
1.3催蕾室要求室温保持在13～14℃，空气相对湿度85%～90%，黑暗。室内要设置不出风的翅片冷却器、加湿器和吸、排气孔用于通风。
1.4抑制室使菇蕾培养成整齐、圆整而结实的金针菇的菇房，室温要求4℃左右，空气湿度80%～85%。为使子实体的水分蒸发，要安装由上往下吹风的冷风机组、换气阀或全热交换器。
1.5套纸筒生长室为使金针菇菌柄伸长，子实体干燥发白，必须套上纸筒，同时室温要求6～7℃，室内要安装横向吹风的冷风机组。
1.6栽培容器选用容量800～1000毫升、口径7厘米的聚丙烯塑料瓶。
1.7栽培材料采用柳杉木屑和米糠为原料。木屑需在室外一边洒水，一边堆积，任其日晒雨淋，使之腐熟，一般堆积6个月。细木糠是金针菇最好的营养源，其次是麸皮。
1.8培养基制作木屑与米糠的容量比为3∶1，含水量65%。培养基装到瓶肩，要求上紧下松。装瓶结束后蒸气高压灭菌1小时。灭菌后，塑料瓶冷却到18℃左右接种。
1.9菌丝培养由于菌丝的呼吸作用，能使室温升高2～4℃，所以保持室温在18～20℃，瓶内的温度就达23℃。经20～22天，菌丝长满瓶子。空气相对湿度要求在60%，定期通风换气。
2.栽培管理
2.1菌丝满瓶后，要立即进行搔菌。搔菌后，马上移入催蕾室。瓶口立即覆盖报纸喷水保湿，在13～14℃适宜的温度和空气相对湿度80%～90%条件下，过8～10天就可现蕾。
2.2把已形成子实体、菌盖直径为1毫米、菌柄长3～5毫米的瓶子移入抑制室，并给予通风。在室温4℃、空气相对湿度80%～85%的室内约放置10天左右。初期3天吹80～100厘米/秒的强风。
2.3抑制期间要注意换气，菌柄就会长得圆整而结实。当子实体长到瓶口时移至生长室，过2～3天后，子实体就高出瓶口约2～3厘米，这时将扇状、开角为15°左右的蜡质纸卷成筒状套在瓶口上，以达到控制氧气量、抑制开伞、促进菌柄伸延的目的。套纸筒5～6天，子实体长到10厘米时，这时由上往下对菌盖吹风，使菌盖、菌柄干燥发白、整齐。生育室的室温要求在6～7℃，空气相对湿度85%左右，
3.采收与加工
3.1采收当金针菇长到15～16厘米长，菌盖内卷呈半球形、直径1～1.5厘米时，即可采摘。一手按住瓶、袋口或菇床，一手轻轻握住菇，从培养基质上拔下，基部切除干净，放在适合的容器里。瓶栽产量100～180克/瓶。
3.2分级金针菇采收后即进行分级，分级标准如下。
一级菇菌柄长15厘米、菌盖直径约在1厘米以下，内卷、白色（或菇体2/3白色、1/3淡黄色），圆整、无畸形菇、无腐烂变质、无病虫害。
二级菇菌柄长13厘米、菌盖直径约在1.5厘米以下，菌盖内卷、菇体白色（或菇体1/2白色、1/2为淡黄色或金黄色）、圆整、无畸形菇、无病虫害、无腐烂变质的。
三级菇菌柄长短于6厘米或长于20厘米，菌盖直径不超过2.5厘米，菇体金黄色或淡咖啡色，并且无畸形、无病虫害、无腐烂变质。
3.3保鲜与加工金针菇的保鲜可采用抽真空后低温（4℃）保藏，时间为25～30℃。另外，也可制成清水罐头、烤成干品和进行盐渍加工。
