红豆杉大多采用种子繁殖。11月种子成熟后即可采收，之后将肉质种皮清洗干净晾干，随即用湿沙层积埋藏在背阴干燥处，上面覆盖塑料膜及草帘。夏秋季应每月翻动种子两次，到次年3月初即可播种育苗。苗床应选择背风且排水良好的微酸性沙壤土地块，床宽1米，沟宽40厘米，东西向起高垅，垅两侧埋25厘米高、4厘米厚的钢板，深10厘米。
床土要求深翻并精细耕作，施入呋喃丹防治地下虫害。用蛭石、河沙、泥炭、园土各一份，并加入多菌灵或甲基托布津等杀菌剂，混合成基质填入钢板内，与侧板平中间高出3～5厘米。覆上塑料膜密封熏蒸3至5天即可播种。
种子均匀散播于床面上，每平方米播种量在200粒左右，播种后用木板略压平，盖1至2厘米厚的混合基质土，覆盖草帘或塑料膜保温保湿。遇天气干燥应适当喷水，一般40天后可发芽出苗。此时应去掉塑料膜或草帘，并在苗床上方搭设2米高的遮阴棚，上盖遮阴网防止阳光直射。
保持苗床湿润，遇雨天应搭低拱棚并盖塑料膜防止苗床水分过多。做好苗床的排水通风工作，及时防治病虫害。幼苗期每隔10天施一次腐熟淡饼肥水，忌用化肥和浓肥。幼苗经过一年的精心养护管理，苗高可达15～25厘米，并有2～3个分叉枝。
4月上旬可进行移植。种植地应选择背风、干燥、富含腐殖质的微酸性沙壤地，深翻20厘米，每平方米施5公斤腐熟有机肥。起高垅，挖深沟，垅宽100厘米，沟宽30厘米。每垅种5行，行距20厘米，株距15厘米。移植宜选在阴天，应随移随种，需带土球移栽。
移栽后马上浇一次透水，并在上面搭2米高的遮阴棚，晴天盖遮阴网，阴雨天及晚上可将其去掉。生长期加强肥水管理，一般每隔10天施一次腐熟饼肥水。做好病虫害防治管理。夏季加强遮光降温工作，必要时采取喷水降温，以创造冷凉湿润环境利于苗木生长。
红豆杉既是制作高档家具的上等材料，又是极具医疗价值的药材，更是园林绿化的优良树种，随着其人工繁殖和人工栽培技术的成熟和发展，红豆杉的应用范围将更加广泛。
用红豆杉种子繁育苗木时，要注意种子的储存方式，要沙种混藏或控温处理，这对越冬后出芽和打破休眠习性，具有很好的效果。
播种前要搓伤种皮、温水浸种、药剂激素处理。出苗后遮阴是育苗的关健。可防止苗木高温灼烧保持湿润、透光度在40%为宜。东北红豆杉和南方红豆杉出苗率均可达到70～80%，要求出苗温度高于15度。
实生苗幼苗的动态生长情况是：实生苗的株高和茎粗在出苗的前两年生长缓慢，株高一般年生长10cm左右，移栽一年以后生长加快。3～5年 年增加量可达20～30cm。
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