种球在盆器中装上1至2英寸厚的介质。下种时，将种球根部向下放到盆器中，种球与盆器边缘应保持半英寸距离。与其他种球植物不同的是，百合需要尽可能地深植。
在春末、夏季和初秋时，应将植株放置在凉爽地区，以利于其生根。先将其放置在温度约9℃的环境中，并持续两周时间；看见百合发芽后，将温度逐渐升至13℃，这样植株根系能很好的生长。在夏季，植株拥有一个健壮的根系至关重要，发达的根系能使其在较高温度下生长良好。
温度控制温度是百合生长过程中最重要的因素，其中四个阶段的温度控制非常重要。
1.在栽培初期，种植者可以将盆器挨着摆放以节省空间。这个阶段，温度可先维持在9℃左右，之后逐渐升高至13℃，并持续两至三个星期。在这一阶段，植株开始发芽，并长出根系。
2.植株长出叶子后，将平均温度升到16℃，夜温保持13℃，日温保持18℃，种植者可根据不同品种进行调整。第二阶段，东方百合需要的时间长一些，亚洲百合需要的时间较短，OT、LA、OA百合处于前两者中间。第二阶段是百合生产过程中最重要的阶段，控制温度能使植株在以后的生长期进一步发展根系，并长出强壮的茎秆。
3.在亚洲百合的萌芽阶段，将夜温提高至14℃，日温保持在20℃。对于东方百合来说，温度可以高一些，保持在17℃至22℃之间。亚洲百合一旦发芽，之后的生长就会非常快速。一般来说，亚洲百合在植株发芽两至三个星期后，种植者可以看到第一批花苞开花，而东方百合需要的时间较长。
4.在植株开花前一周，将夜温降至13℃，日温降至18℃，这样有助于花朵色素沉淀。根据经验，在较低的温度下，花朵颜色会更加鲜艳，并有较长的花期。这一阶段的时间控制非常关键，如果这个阶段太短，那么产品品质就会大打折扣。
光照控制如果生产者想在苗床上摆放尽量多的植株，那么就要处理好光照和植株间距之间的关系。盆栽百合在夏天只要适度光照即可，冬天则需要高强度光照，所以种植者应在夏季的后半段应适当对其采取遮阳处理，而在低光照的冬季则适度进行补光。种植者在夏季栽培盆栽百合时，可以选择户外有树木遮阴的地方，虽然培育期间可能会出现几次炎热天气，但夜温下降会很快。根据经验，在植株生长过程中，当日温较高和夜温较低同时出现时，两者作用相互抵消，不会影响花卉品质。当然，如果是遇到32℃以上的高温天气，则通常会导致花蕾裂开，花瓣和茎叶萎蔫直至坏死。
水肥控制在百合生产过程中，通常应用滴灌方式进行浇水，在寒冷、光照较弱的冬季，这种方法尤其适用。根据经验，直接浇灌植株顶部是行不通的，而且每次浇水量不宜过大。
每逢浇水时，种植者可以将肥料液化施用，然后再用清水将容器洗刷干净以防盐碱化。一般来说，冬季生产时，可以使用花多多15-5-15的肥料，到了夏季使用花多多20-10-20产品。300ppm的滴灌施肥一般便可满足植株需要。有时，一些不良天气可能导致植株出现焦叶病或茎秆细弱，可适当补充250ppm的硝酸钙。对于容易患叶焦病的品种，也可使用这一招。
根据天气条件和季节因素调控浇水量。低温下栽种百合，要保持微湿环境。日光强烈时期，浇水显得非常重要，这是因为植株长时间缺水会损坏植物根系，因此夏季栽种百合保持环境湿润至关重要。
高度控制盆栽植物中，矮株品种一般比较受青睐。一些东方百合品种如‘MonaLisa’、‘After Eight’以及“Sunny”系列都非常适合盆栽，甚至不需要施用植物生长调节剂。
在植株高度不理想时，植物生长调节剂B9能帮助生产者很好地解决这一问题，种植者可以依据季节和光照适度应用。一般情况下，将球茎浸在浓度为2.5ppm的B9溶液中效果最好，当植株出现徒长情况时，可以喷洒浓度为5ppmB9。
病虫害防治对于盆栽百合来说，虫害的防治并不复杂。种植者可以按照日常防治计划喷药，如喷洒一些防治蚜虫和蓟马的药剂。当对植株进行顶部浇灌，或植株长时间处于高湿环境下，容易发生霉腐病。用船舶运输开花植物时，霉腐病更易发生，因此在船运时，适当使用防治霉腐病的杀菌剂能更好保持产品质量。
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