辣椒杂交制种产量的高低主要取决于单位面积株数、单株杂交果数、单个杂交果种子数量和杂交种子千粒重等因素。同时，栽培技术和杂交授粉技术也与之密切相关。本文就高产制种的几个关键技术措施进行了总结概括。
一、播期辣椒制种播期，以保证花期相遇，本着父本先开花、等待母本的原则来确定。依据父母本的熟性早晚，一般播期在12月上旬－元月上旬。
二、播种育苗
1、浸种消毒。把种子浸入50－55℃的温水中，水量以浸没种子为宜，不停地搅拌，直至水温降至30℃左右时停止搅拌，再浸泡8－12小时后捞出，接着用10％磷酸三钠溶液或2％氢氧化钠溶液浸种15－20分钟，然后多次淘洗，洗净后催芽。一般在28－30℃的恒温条件下进行。在催芽过程中要经常翻动种子，并且每天用加入0．02％硼酸的清水清洗种子一次。待发芽率达60％时即可播种。
2、苗床准备。先配制营养土，用腐熟的有机肥（马粪、猪粪或鸡粪）6份，加葱蒜地表土4份，混合均匀后过筛，同时加入少量多菌灵、百菌清以防治病害。苗床可在阳畦或日光温室准备。每平方米育苗床内可施入腐熟有机肥5公斤，二铵0.25公斤，然后深翻、耧平，待播。
3、播种。播种时，先浇明水达6厘米左右，水渗完后撒极薄一层代森锰锌药上，均匀播种，一般每平方米播10克左右。种子播完后，再覆盖极薄一层药土，然后撒盖0.8－1.0厘米厚的营养土。
4、苗床管理。出苗前白天温度保持在30℃左右。夜间18－20℃。幼苗出土后适当降低温度，加大昼夜温差，防止幼苗徒长。此时白天温度控制在23－25℃，夜间控制在15－17℃，这样即可以防止下胚轴过长，长成高脚苗，又可以保证子叶肥大，叶色深绿，生长健壮。要控制浇水，若叶片中午有萎蔫症状时可用喷壶喷水。当幼苗长到2片真叶时，即可分苗移植。一般采用在分苗畦内按10厘米X10厘米的株行距分苗，或采用单株移栽到8厘米X10厘米营养钵中。分苗期间，白天温度控制在28－30℃，夜间18－20℃，在中午前后苗子萎蔫时要进行遮阴。在齐苗时、第1片真叶出现后、缓苗后和4叶期时要各覆土0.5厘米，均用营养土。湿度以手握成团，撒手为粒为好。苗期还应尽量增加光照时间，每天应达8小时以上。定植前7－10天，要低温炼苗，白天控制在20℃左右、夜间12－15℃。
三、定植
1、整地施肥。在整地前要施入足够的腐熟有机肥5000公斤，磷酸二铵30公斤，硫酸钾20公斤，深耕30厘米，使肥料和土壤充分混匀，以提高土壤保肥蓄水通气能力。
2、定植。采用高垄定植，覆盖地膜。地膜一定要封严防止漏风灼苗。一般于3月中下旬定植母本于大棚，父本早母本半个月定植。为保证制种后期花粉供应，还可将部分父本稍后定植于大棚。定植的株行距为30厘米X50厘米。每667平方米定植4000株左右，父母本比例为1：2．5－3。
四、田间管理定植后至4月中旬前，主要进行保温防寒，以后主要进行通风降温和湿度管理，特别是5月中旬后干热风多，要勤浇水降温，保持棚内一定的湿度，防止花粉失水干燥，发芽力降低和母本柱头失水脱落。肥水管理主要是制种前要尽可能使母本发育起来，最好于晴天穴施尿素；开花前期要小水勤浇，使开花集中，提高开花数，同时也提高棚内温度。一般在母本坐5个果以后要进行根处追肥，可在早上授粉前喷0.3％的磷酸二氢钾。父本于开花中期后要适当控水，延长开花期。授粉后期，母本适当控水，并加强病虫害防治。
五、病虫害防治辣椒的主要病害有猝倒病、立枯病、疫病、病毒病、炭疽病、灰霉病和青枯病等。猝倒病可用25％甲霜灵800倍或58％甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液防治。每隔7－10天喷1次。连续喷2－5次，苗床喷洒药剂后，用细干土或草木灰撒施在苗床上，以降低苗床湿度，控制病害蔓延。并要尽快清除病菌，以及发病植株周围的病土，烧毁病株。发病处用40％五氯硝基苯浇灌消毒。立枯病可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍或70％百菌清可湿性粉剂600倍液防治，每7－10天喷洒1次。喷药时应尽量喷在茎基部或直接用药浇灌。疫病可在种植前用硫酸铜每667平方米5公斤进行沟施或穴施处理土壤。发病时可用72．2％普力克水剂600－800倍液或72％普力克可湿性粉剂600－800倍液防治。也可用安克锰锌600－800倍液或霜脲锰锌600－800倍液喷根。棚室可用溴甲烷每平方米50－75克密闭熏蒸2－3天，然后揭膜散气7－10天。病毒病可用病毒K500倍液或20％病毒A可湿性粉剂500倍液防治。炭疽病可用20％炭特灵可湿性粉剂500倍液或25％施保克可湿性粉剂500倍液防治,每隔7－10天喷1次,连喷3－4次。灰霉病可用50％多霉灵可湿性粉剂1000倍液或65％甲霜灵可湿性粉剂600倍液防治。青枯病可用47％加瑞农500倍液或77％可杀得可湿性粉剂500倍液灌根,也可用40％福尔马林或20％石灰水对病株附近土壤消毒。 虫害主要是白粉虱和蚜虫。白粉虱可用25％扑虱灵可湿性粉剂1000－1500倍液或2.5%的天王星2000－3000倍液防治。蚜虫可用50％抗蚜威可湿性粉剂2500倍液或40％氧化乐果乳油1000－2000倍液防治。
六、杂交制种技术
1、母本杂交花位和花朵的选择。门椒由于温度低，本身生长不良，坐果后种子少，并且与上部花、果竞争养分，一般不进行杂交。授粉从对椒以上部位开始。选择的花朵，应是花蕾充分长大，花苞发白，第二天即将开放的花。
2、花粉采集。辣椒在上午9点左右大量散粉，应尽量在8点之前摘回花蕾，放在干燥器中，于当天下午取出雄蕊，用花粉筛将花粉筛出，或把干燥的雄蕊放于封闭的玻璃盒或塑料盆中摇动，使花粉散落，然后放在温度20℃的通风房间贮藏备用。
3、去雄授粉。用一只手按住母本的花萼，另一只手捏住花瓣基部，轻轻一拧，再一拔，即可将花瓣和雄蕊全部去掉。接着将柱头小心蘸授粉器中的花粉。授粉后在花前摘叶做标记或点红漆做标记。授粉时已开的花要及时摘除，以保证杂种纯度。
4、适时采收。标记辣椒红熟后，使其在植株上后熟4－5天，摘下立即取出种子，放在散射光下通风处晾干，使种子呈金黄色，防止种子受潮，影响种子生活力和商品性。
