青霉病由青霉菌引起。病菌会感染受机械损伤的种球，也可能感染那些表皮还是白色、收获较早且在低温和潮湿环境下储藏的种球。此时，种球的表皮将附着一层蓝绿色的菌丝，但内部的鳞片不会受影响。有时，该病菌也会出现在发生叶片倒伏症状的植株上。
预防措施：避免损伤种球和芽；种球到货后，将它们储藏在通风良好而且相对湿度足够低的储藏室中；在种植前根据建议对种球进行消毒。
软腐病由腐霉菌引起。真菌在种植后前几个星期，土壤温度高于12℃时开始感染种球。早期被感染的植株只发出很短的芽，种球组织变软，通常呈粉红色，并释放出一种特殊的、难闻的气味，与感染镰刀菌的种球相似。茎和根在开始阶段看上去还健康，但是以后将全部腐烂。后期被感染的植株生长不良、叶尖发黄、植株倒伏，在一定的环境下花苞在最后阶段也会干枯。
预防措施：种植前应从根盘处将种球的表皮除去，并对种球进行消毒；生根期，土壤温度应低于12℃，最好是低于10℃；土壤结构一定要好，而且排水要通畅。
枯萎病由郁金香尖孢镰刀菌引起。贮藏时期被感染的种球上出现灰褐色小斑点，有时会有同心圆或明显的黄色边缘。种球枯萎，表皮疏松，释放出一种特殊的难闻的气味及乙烯气体。感染不严重时，植株生长缓慢，花苞尖端变黄、变干。将植株进行纵切就可发现，茎内从基部开始变为褐色。感染枯萎病的郁金香种球会释放出乙烯气体进入土壤，造成周围其它植株生长缓慢，甚至花苞干枯。在栽培5℃郁金香种球时，尤其是种植比较早，种植温度在13℃以上时，感染该病菌的几率较高。
预防措施：贮藏时需提供足够的通风；种植前应除去受感染的种球并消毒种球，5℃郁金香球种植时土温要在12℃或更低；及时挖去种植后未发芽的种球。
灰霉病由郁金香灰霉病葡萄孢菌引起。种球和根系都有可能被感染。种球感染后，种球的一层或多层鳞片部分或完全发软并变为深褐色，在感染的组织上有2～3mm大的黑色扁平菌核。地面以上部分感染后，植株脆弱，会突然折断；花苞与正常植株相比，其颜色变暗；叶片由于蜡质层被破坏而失去光泽，有褶皱状的水泡；严重感染的植株生长很矮或花不会开放。在温室土栽时，土壤中加入有机肥料后更易产生灰霉病。灰霉菌产生的斑点较小，且只发生在叶片上，不发生在花苞上。
预防措施：种植前进行种球消毒；不要在纯泥炭基质中种植；箱栽时，通过将相对湿度提高到90％～95％来防止根系干枯受损。
褐斑病由郁金香褐斑病葡萄孢菌引起。严重感染的植株不会开花或生长停滞。茎最下面的叶片卷曲，上面生长大量灰褐色的真菌孢子。地表以下部分会产生1～2mm大小的黑色菌核。病菌孢子的萌发会在叶片和花上引起小的水浸状的斑点。这些斑点起初为绿色，以后变为大的白色或褐色斑点。
病菌的菌核和孢子只在潮湿条件下萌发。孢子可通过水分或空气的流动进行传播，在叶片上24小时之内、在花上10小时之内便可形成“灼伤”斑点。
预防措施:种植前，对温室及土壤进行消毒；种植前消毒种球，且不要种植过密；没有发芽的种球应及时除去；使用杀菌剂进行预防；最好在早晨浇水；保持植株干燥，尤其是夜晚更应如此；防止植株积水，相对湿度应在85%～90％，保持空气流动。
立枯病由立枯丝核菌引起。感染郁金香在土壤中的芽体，植株长出地面后就不会进一步受害。芽上形成橙褐色的斑点和条斑，以后植物的组织开裂，通常能正常开花，但底部叶片的尖端向外卷曲。感染严重的植株，茎基部呈椭圆形，严重内陷，植株生长缓慢，加工时容易折断。
预防措施:种植前，对温室以及土壤进行消毒；种植前消毒种球，且不要种植过深。
