1.病害
荔枝和龙眼的病害种类约有40余种。在福建省发生为害较为严重的有龙眼鬼帚病和荔枝霜疫霉病。
1.1 龙眼鬼帚病 受害的龙眼幼叶狭小，叶缘内卷，重者全叶呈线状，烟褐色；成叶凸凹不平、叶缘卷曲；病梢秃枝，呈扫帚状；花朵畸形，不能结实，即使结实也不能食用。防治上应注意严禁从病区输入苗木、种子和接穗，苗圃或新植园一旦发现病株，要及时拔除烧毁。发病轻的龙眼树应及早剪除病梢病穗，加强管理，增施有机肥，及时防治荔枝蝽和角颊木虱等传毒介体。
1.2 荔枝霜疫霉病 是荔枝果实上的一种重要病害，有时叶片也受害。果实受害，多从果蒂开始，初期果皮出现褐色病斑，随后全果变为黑褐色，果肉腐烂，以后病部长出白色霉状物。防治上一是加强果园管理，采果后清除烂果、病果、落果集中烧毁，然后在树上、地面喷0.2～0.3波美度石硫合剂。二是喷药保护，因该病为害时间在花期、果实生长后期及贮运期，所以可在花蕾期施用2～3次安克锰锌600倍液（或500～800倍瑞毒霉锰锌或氧氯化铜600倍液），以保护花穗，每次相隔10d左右，在幼果期和果实成熟前15～20d各再喷一次安克锰锌500倍液或瑞毒霉锰锌600倍液。此外，若果实采收后需保鲜贮运的，可在采收前3d再喷一次安克锰锌500倍液，可提高保鲜效果。根据广东农科院的试验结果，使用美国氰胺公司生产的安克锰锌防治荔枝霜疫霉病，健果率达90％以上。
2.虫害
荔枝和龙眼已发现的害虫有50多种，其中发生普遍，为害较严重的有荔枝蝽、荔枝蒂蛀虫、荔枝尖细蛾、龙眼亥麦蛾、龙眼角颊木虱等5种，其中前4种同时为害荔枝、龙眼，角颊木虱只为害龙眼。在我省，以荔枝蝽和荔枝蒂蛀虫为害荔枝、龙眼最为严重。
2.1 五种主要害虫及为害特点
2.1.1 荔枝蝽 成虫盾形、腹面有白色腊粉，年发生一代，我省4～5月为害最重，成、若虫刺吸嫩梢、花穗、幼果，引起落花落果，严重影响产量。害虫受惊动时会射出臭液（故俗称臭屁虫），触及人的皮肤或眼睛，会引起辣痛。
2.1.2 荔枝蒂蛀虫 为害荔枝、龙眼枝梢、花穗及果实，但不为害叶。年发生约10代，世代重叠。成年树上为害较重，梢被害率7%～12%，果被害率12%～18％。
2.1.3 荔枝尖细蛾 幼龄在荔枝、龙眼叶上潜食，3龄后即蛀入叶脉或嫩梢，为害后期叶片状如火烧。年发生约10代，9月上旬幼虫高峰期常造成荔枝、龙眼秋梢严重受害。
2.1.4 龙眼亥麦蛾 年发生5代，世代重叠。幼虫蛀食龙眼、荔枝枝梢、穗及幼果，被害枝梢萎缩，重者枝梢枯死。一般以6～8月为害最重。
2.1.5 龙眼角颊木虱 成虫和若虫在嫩梢、芽、叶上吸食为害，若虫期通常固定于幼叶叶背吸食，形成凹陷虫孔，叶面突起。年发生7～8代，世代重叠，以龙眼春、秋梢期受害最重。
2.2 防治方法
2.2.1 龙眼主要害虫的综合防治 龙眼园一年施药一般为4次，第一次在春季修剪后于3月上旬春梢抽发5～8cm时进行，用80％敌百虫800倍液加25％杀虫双500倍液喷雾，防治荔枝蝽和木虱，并视尖细蛾和亥麦蛾发生情况，必要时再加20％杀灭菊酯2000倍液普治。第二次在5月上中旬初花期进行，可用10％高效灭百可3000倍液或80％敌百虫500倍液防治荔枝蝽成、若虫。第三次在6月下旬至7月上旬谢花后夏梢抽生8～10 cm时进行，可用10％高效灭百可3000倍液或5%卡死克1500倍液防治尖细蛾、蒂蛀虫和亥麦蛾，兼治荔枝蝽和角颊木虱。第四次在9月中旬秋梢抽发8 cm时进行，可用2.5％敌杀死3000倍液或10％高效灭百可3000倍液防治尖细蛾、蒂蛀虫、亥麦蛾，并兼治木虱和荔枝蝽。
2.2.2 荔枝主要害虫的综合防治 荔枝园全年施药一般4～5次。第一次在春梢、花蕾期，重点防治荔枝蝽，可在3月中下旬用90％敌百虫600～800倍液加水胺硫磷或三氯杀螨醇800倍喷杀。第二次在幼果期，重点防治蒂蛀虫，并兼治荔枝蝽，一般在荔枝谢花后10d用高效灭百可3000倍液或25％杀虫双500倍液。第三次在果实发育期，重点防治蒂蛀虫，在果实迅速膨大期、果实开始转色期及采果前20 d各用一次药，以10％高效灭百可3000倍液防效最佳，并能兼杀卵作用；杀虫双加敌敌畏也可配合使用。第四次在秋梢展叶期，主要防治食叶和蛀梢害虫，如蒂蛀虫、尖细蛾、卷叶虫、瘿螨等，可选用10％高效灭百可3000倍液，或水胺硫磷、万灵、敌敌畏等，在秋梢刚萌发时进行喷杀。
