桉扦插条腐烂病的6种致病病原菌，都是比较弱的寄生性病原菌，习居于土壤并能生存1至数年，这些病菌一般不侵害完整健壮的植株。桉插条从亲本切离后，已经不能从根部得到维持其生理活动所必需的水分和养分，不仅对病原菌的抵抗力减弱，而且在切口部分形成了大的伤口，病原菌很容易从切口侵入，并通过水分流动和气流传播。桉扦插育苗一年四季均可进行，腐烂病周年都会发生。一般从1月到第二年3月，插条的腐烂最少，5―9月为发病的高峰期，腐烂率往往在50%以上。过湿和高温是病害流行的重要因素。当插床土壤含水率保持在45%左右，插床温度20摄氏度以下时，腐烂发展缓慢，总枯死率最低。一年中扦插条不同时期侵害病菌种类不尽相同，早春以葡萄孢菌，交链孢菌和丝核菌为主。春末夏初则以柱枝双孢霉菌和镰刀菌侵染为主。盛夏高温则以芽孢杆菌和柱枝双孢霉菌侵染为主。冬天又以交链孢菌和丝核菌侵染为主。
桉扦插条腐烂病的防治，关键要保持插床和温室无菌、清洁，一般应对插床和插穗进行消毒。同时定期对扦插条喷药保护。插床土壤可用五氯硝基苯加敌克松与土壤混合消毒。插穗可用600―800倍液百菌清加1000单位/毫升的链霉素消毒。发药高峰期应用杀真菌剂百菌清加杀细菌药物链霉素喷洒保护。
