农业防治是无公害蔬菜病虫综合防治技术的基础。采用合理的农业技术措施，创造有利于蔬菜生长，不利于病虫发生为害的生态环境条件，增强蔬菜植株的抗逆性，减轻病虫为害。
1、加强植物检疫根据国家的植物检疫法规、规章，严格执行检疫措施，防止危险性病虫杂草如黄瓜黑星病、番茄溃疡病、美洲斑潜蝇、南美斑潜蝇、肠草等有害生物随蔬菜种子、秧苗、植株等的调运而传播蔓延。
2、选用抗（耐）病虫品种选用抗（耐）病虫品种是防治蔬菜病虫害最根本的既经济又有效的措施。各地可以结合当地种植的蔬菜种类和病虫发生情况，因地制宜选用抗病品种，减轻病虫为害。
3、用无病种子或进行种子消毒无公害蔬菜应从无病留种田采种，并进行种子消毒。常有的方法有温汤浸种（如黄瓜，把种子放入55℃热水中浸泡15分钟，边浸泡边搅拌，待水温降至30℃时，停止搅拌，继续浸泡3～4小时，取出晾干催芽，可预防苗期病害）：或采用药剂拌种和种衣剂包衣等方法进行种子处理。
4、培育无病壮苗，防止苗期病虫害育苗场地应与生产地隔离，防止生产地病虫传入。育苗前苗床（或苗房）彻底清除枯枝残叶和杂草。可采用培育钵育苗，营养土要用无病土，同时施用腐熟的有机肥。加强育苗管理，及时处理病虫害，最后汰除病苗，选用无病虫壮苗移植。
5、清洁田园病虫多数在田园的残株、落叶、杂草或土壤中越冬、越夏或栖息。在播种和定植前，结合整地收拾病株残体，铲除田间及四周杂草，拆除病虫中间寄主。在蔬菜生长过程中及时摘除病虫危害的叶片、果实或全株拔除，带出田外深埋或烧毁。
6、适时播种合理选择适宜的播种期，可以避开某些病虫害的发生、传播和危害盛期，从而减轻病虫危害。如大白菜播种过早，往往导致霜霉病、软腐病、病毒病、白斑病发生较重，而适时播种既能减轻病虫危害，又能避免迟播造成的包心不实。
7、合理轮作、间作、套种蔬菜连作是引发和加重病虫为害的一个重要原因。在生产中按不同的蔬菜种类、品种实行有计划的轮作倒茬、间作套种，既可改变土壤的理化性质，提高肥力，又可减少病源虫源积累，减轻危害。如与葱、蒜茬轮作，能够减轻果菜类蔬菜的真菌、细菌和线虫病害，水旱轮作可明显减轻番茄溃疡病、青枯病、瓜类枯萎和各种线虫病等病害。
8、深耕晒垡深耕可将土表的蔬菜病残体、落叶埋至土壤深层腐烂，并将地下的害虫、病原菌翻到地表，受到天敌啄食或严寒冻死，从而降低病虫基数。而且使土壤疏松，有利于蔬菜根系发育，提高植株抗逆性。
9、科学施肥合理施肥能改善植物的营养条件，提高植物的抗病虫能力。应以有机肥为主，适施化肥，增施磷钾化肥及各种微肥。施足底肥，勤施追肥，结合喷施叶面肥，杜绝使用未腐熟的肥料。氮肥过多会加重病虫的发生，如茄果类蔬菜绵疫病、烟青虫等为害加重。施用未腐熟有机肥，可招致蛴螬、种蝇等地下害虫为害加重，并引发根、茎基部病害发生。
10、嫁接防病嫁接技术的广泛应用有效地减轻了许多蔬菜病虫害的为害。瓜类、茄果类蔬菜嫁接可有效地防治瓜类枯萎病、茄子黄萎病、番茄青枯病等多种病害。
11、采用脱毒种苗防病脱毒种苗繁育技术是防治病毒病的最有效方法。采用马铃薯、大蒜、甘薯等脱毒种苗防治病毒病己大面积推广应用，并取得良好效果。
