绿甘蓝生长后易发生黑腐病、菌核病等，除及时拔除病株、避免积水、适量施用氮肥之外。主要用25%叶枯灵可湿性粉剂200倍液，25%川化018可湿性粉剂1000倍液防治。
绿甘蓝易受地老虎、蚜虫和小菜蛾的为害。除及时清除田间枯、残叶株，诱杀成虫之外，可用苏云金杆菌乳剂对水500-800倍液进行生物防治，还能兼治其他害虫。另外，还可用25%灭幼脲1号500-1000倍液防治。
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