茄子整个生育期均可发生菌核病，主要在成株期发病，危害茎、叶、花和果实。苗期发病开始于茎基或侧枝，先出现浅褐色水渍状病斑，以后病斑绕茎一周，湿度高时病斑上长白色棉絮状菌丝，菌丝干燥后变成灰白色，并集结成菌核，病部缢缩，茄苗枯死。成株期发病，先在茎基部和侧枝基部产生水浸状斑，以后病斑扩大，呈淡褐色、稍凹陷，湿度高时病部长出白色棉絮状菌丝，茎秆内髓部受破坏，腐烂、中空，剥开可见黑色鼠粪状菌核，干燥后表皮易破裂；在幼果脐部或向阳部出现水渍状腐烂，以后病斑扩展，呈褐色、稍凹陷，并着生白色绵絮状菌丝，形成黑色粒状菌核。病菌喜温暖潮湿的环境，最适发病温度为２０～２５℃、相对湿度为８５％以上，成株期至结果中后期最易感病，发病潜伏期为５～１０天。早春或梅雨期多雨、湿度大，连作，地势低洼、排水不良，种植过密、棚内通风透光差，氮肥施用过多，植株长势弱或受霜冻危害等易发病。
夏季对发病地块浸水闷棚，可以抑制病害发生。早春多雨天气，每亩大棚用４５％乙熏灵２５０克或５０％百菌清粉尘剂１０００克熏蒸，每周一次，连续２～３次。其余时段可以选用５０％速克灵可湿性粉剂１０００～１２００倍液、５０％农利灵可湿性粉剂１０００倍液、４０％施佳乐悬浮剂８００倍液、６５％腐霉灵可湿性粉剂６００～８００倍液、４０％嘧霉胺可湿性粉剂６００倍液、４０％菌核净可湿性粉剂５００倍液、５０％苯菌灵粉剂１５００倍液、５０％扑海因可湿性粉剂６００～８００倍液等药剂，每隔７～１０天喷一次，连喷３～４次。
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