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舍饲是对我国西北地区传统养畜方式的改变，它给了牧场以休养生息的机会，减轻了天然草场的放牧压力，让水土流失得到治理。牛羊等放牧家畜饲养方式的改变，无疑给兽医疾病防制提出了新的课题，也提出了更高、更新的要求。尽管舍饲对某些牛羊疾病的控制有着良好的作用，但是也可能会引发一系列新的疾病出现。为此，我们进行了下述研究和探讨。
1 疫病流行的新特点
1.1 寄生虫病 由于舍饲采取了封闭式管理，使得牛羊等反刍家畜缺少了与草场环境中某些寄生虫中间宿主接触的机会，从而可减少某些寄生虫病的发生，如大多数吸虫病就是如此。因为螺蛳多是吸虫的中间宿主，主要生存在潮湿有水的湖泊沟渠旁。牛羊在这些地方放牧食草或饮水时，最易发生感染。且病畜将粪便排入水中，加剧了吸虫病的恶性循环；而舍饲之后，动物就很少有接触螺蛳的机会了，也不会排出虫卵污染外界草场，切断了吸虫病的传播途径，因而也就会较少吸虫病发生。但某些绦虫，如莫尼茨绦虫、曲子宫绦虫和无卵黄腺绦虫，其中间宿主为地螨，在腐殖质较多的舍饲土壤环境中可能更多，因而在舍饲条件下，家畜可能更为易感。
在线虫感染方面，特别是寄生于反刍家畜消化道中的土源性线虫，一般主要是通过宿主粪便排出虫卵或幼虫，易感动物经口发生感染。在舍饲条件下，如果不注意及时清理粪便，排出的虫卵和幼虫就会在圈舍环境中发育，从而造成这类寄生虫病的传播，如捻转血矛线虫等其他毛圆科线虫病就是如此。
由于舍饲与放牧相比较，属于较高密度的饲养。故牲畜之间高频繁接触，那么可能导致某些经接触感染的寄生虫病发生、流行，如螨、虱等一些外寄生虫病。一般舍内湿度和温度较高，畜群拥挤，极易导致螨病的流行。另外，较封闭的圈舍四季变化较小，可能无明显季节温度的变化，这就可能使得原为季节性流行的一些寄生虫病克服了季节障碍，变得一年之中都可能发生流行。另外，如圈舍卫生状况不良，夏季时，蚊蝇及其他一些吸血昆虫较多，那么就可能容易传播某些血液性寄生虫病，如牛羊的梨形虫病、丝虫病等。
在放牧转为舍饲后，驱虫、防虫可能变得更加便利。但是寄生虫的种类和流行病学规律可能会有所变化。
1.2 传染病 在舍饲条件下，如果舍饲的畜群中有传染源，那么比放牧条件下，可能更易导致整个圈舍家畜疫病的相互传染流行。舍饲疫病传染大致有3种途径：一是经分泌物和排泄物的传染；二是经空气的传染；三是由于饲养管理不当造成的传染。家畜的分泌物和排泄物可成为许多病原的载体，加之牲畜间及牲畜和用具间密切的接触，使得许多传染病在圈舍内流行。如某些病毒可能随病畜的分泌物和排泄物排出而污染饲草和饮水，经消化道引起其他健康家畜感染；又如羊支原体性肺炎主要经病畜呼吸道分泌物排菌，通过空气飞沫经呼吸道传染；此外，由于圈舍不洁，还可以造成羊坏死杆菌病的流行。冬季舍饲期间，家畜更喜扎堆拥挤，接触机会较多，如果舍内温度较低，湿度较高，通风不良，常易促使经由空气传播的传染病暴发流行。如在寒冬或初春季节，容易发生某些呼吸道传染病。如果不同年龄的羊混养，就会增加相互感染疾病的机会。一般而言，幼龄动物与成年动物相比，对疾病的抵抗力是较低的，这样对幼畜生长发育非常不利。
在舍饲情况下，当某些传染病发生时，一般便于采取措施，控制疫情扩散，可防止地区范围内大面积的疫病流行。而且某些传染病通常在圈舍环境中不易发生。如炭疽的发生往往是由于患炭疽死亡牲畜的尸体处理不当，炭疽芽胞污染了土壤、牧地、水源，形成了长久的疫源地。家畜在放牧情况下，采食污染的饲草、饮水经消化道感染。在家畜由放牧转为舍饲后，传染病的防疫也相应发生了变化。放牧时牲畜在草场中所感染的传染病，病源范围广，难以采取统一的免疫预防措施。而舍饲情况下，免疫预防控制措施只要得当，就容易奏效。只要保证圈舍中没有病畜或带菌、带毒牲畜，并做好环境消毒灭菌工作，那么传染病的防疫工作还是比较好做的。
1.3 其他疾病 在某些西部地区草场中，一些耐干旱，耐严寒的毒草已经发展成优势种群。如有毒紫云英、棘豆草、小萱草（根）、毒芹、蓖麻子等，它们被放牧家畜吃了以后，多会发生中毒。有些特别是在青苗的时候，毒性更强。而舍饲的封闭式管理，阻止了羊群吃食毒草的可能。但是在舍饲情况下，如饲养管理不善，牛羊可能会误食农药、杀虫药、杀鼠药污染的饲料而引起中毒。
舍饲过程中，有的畜舍属于开放式或半开放式棚圈，在暑天，由于圈舍条件设施不齐全，可能使牲畜无处躲避炽热的阳光，加之饲养密度较高，牲畜体温升高而易导致家畜中暑。舍饲后，牲畜采食青绿饲料的机会减少或采食不足，而采食大量的粗干草，如不补饲，则摄取的营养物质不能满足畜体需要，容易引起营养缺乏综合征。再之，如饲喂次数与时间不固定，则很容易造成消化功能紊乱，引发前胃弛缓，瘤胃积食等疾病。或由于饲养管理不当，饲喂腐败发霉、不洁的饲料，有时往往出现饲料中毒现象。给妊娠山羊饲喂上述带有毒性的饲料或是频繁变换饲料都可能使妊娠羊流产。
圈舍运动场所小，牛羊运动不足，容易影响动物的生殖机能和发育，造成不孕、不育、流产、弱胎、死胎及发育不良等疾病，特别对一些喜欢运动的家畜，如山羊等更是如此；另外，家畜之间在圈舍中易引起顶伤；地面不平，肮脏潮湿，使牛羊易患多种呼吸道疾病、关节炎、肌肉炎等，也易导致腐蹄病。如不同年龄家畜混养，由于大小悬殊而争食、争地，也易导致踩压或致伤等。另外，当家畜患有腹泻、消化不良等疾病时，排出的粪便腥臭难闻，所产生的氨气刺激了家畜呼吸道黏膜，容易导致气管炎或肺炎的发生。
2 疫病防制的新对策
2.1 消除感染源，确保全群家畜安全健康 在舍饲环境下，确保整群圈舍家畜无病原存在是一个很重要的问题，也是舍饲条件疫病预防中的一个首要问题。因为，一些流行性强、传播速度快的传染病、寄生虫病在圈舍家畜密集、接触频繁情况下，一旦有一个家畜发病，就会立刻引发全群家畜感染，导致巨大经济损失。对外地新引进的家畜要进行隔离观察，确认健康无病后，方可混群，以免把外来病原引入圈舍。
隔离淘汰病畜。一旦发现畜群中有患病家畜，须及时隔离，进行诊断，经确诊后无治疗价值的一律淘汰处理；并对环境做好消毒。平时做好疫病防制预案，要有切实可行的疫病综合防制措施，以免使本来可以预防的疾病造成蔓延。当疫病发生后，不能滥用抗生素等药物，避免造成病原菌产生耐药性，使新的变异株出现，给防制疫病增加一定难度。
2.2 合理适时做好免疫、驱虫工作 坚持预防为主，防重于治的原则。根据舍饲家畜种类，按照传染病科学免疫预防接种程序，结合各地区多年来主要疫病发生规律及流行特点、疾病特征等，适时接种，严格操作规程，使免疫程序规范化、标准化。对寄生虫病要在流行病学调查的基础上，制定驱虫计划，选择广谱驱虫药驱虫，但要注意使用药物的合理性。要经常轮换药物或联合使用药物，在消除虫体来源之后，不要再盲目进行驱虫，以避免抗药性的产生。
2.3 搞好环境卫生防疫，减少感染机会 舍饲条件下，做好环境消毒工作是非常重要的一环，它有助于切断疫病传播途径，有效地减少牛羊疾病。应做到对圈舍、运动场每半月严格消毒一次。可用2％ NaOH、10％石灰乳或5％～10％漂白粉或20％热草木灰水对圈舍进行彻底消毒。要及时清理圈舍中的粪便，这是在舍饲条件下，防控疫病，特别是寄生虫病较为重要的一点，必须给予充分的重视。收集起的粪便要堆积发酵，以杀灭其中的病原体。有条件的圈舍可以采取高楼式养羊，以使粪便随时得到清除，解决草料污染等多种问题，减少日常劳动管理强度，大大提高劳动生产效率。圈舍保持清洁卫生，通风透气，做好灭鼠、灭蚊蝇工作，防止这些传播媒介携带和传播细菌、病毒、寄生虫等病原体，污染饲料、饮水及其他用具、设施，以减少感染的机会。
2.4 加强饲养管理，增强畜体抵抗力 饲料要平衡全价，富含维生素、微量元素，根据畜种的不同发育阶段，合理配制和饲喂全价日粮，干草和青饲料相互搭配，适时补饲，增强畜体抵抗力。棚圈要通风、透光，夏季注意防晒，冬季要保暖，地面最好硬化或定期换土或垫料，以保持干燥和清洁。有些圈舍布局不合理，上风口处设有粪池和尸体处理场，易引起疾病的传播；应将粪池和尸体处理场安置在下风口。家畜饲养密度不可过高，大小家畜最好分开饲养，因为幼龄动物一般抗病能力低，易感染、易发病。要注意预防营养缺乏症、关节炎及风湿病的发生。加强对农药、杀虫药、灭鼠药的管理，防止家畜接触中毒。不要饲喂发霉变质的饲料；饲喂要定时、定量；舍饲的家畜最好定期在运动场或院落中进行适当运动，特别是对种畜，更应如此。
2.5 定期进行疾病监测，建立完善的疾病预防控制系统 在舍饲条件下，疾病的监测应该说是容易、方便一些。所以，有条件的圈舍可根据实际情况，定期对畜群进行重要疾病的监测。做到心中有数，有的放矢地进行疾病防治，逐步建立起一套完善的疾病预防控制系统。
