通常果树进入结果期后，腐烂病开始发生，随着树龄的增加和产量的不断提高，腐烂病会逐年增多，在正常管理情况下，树体负载量是左右发病的一个关键因素。连年结果，要消耗大量的养分，如果养分供给不足，必然招致腐烂病的发生。经实际调查，枝条含水量80%～100%时病斑扩展缓慢，枝条含水量67%时病斑扩展迅速。冬季修剪过重，伤口过多，又未及时消毒保护等，容易导致病害发生。冻害、冰雹等都会加重果树的腐烂病。下面总结一下防治苹果腐烂病的综合方法。
一、涂辣椒汁将病疤用利刀刮净深达木质部，并超出病疤2～3厘米。用鲜辣椒(去柄捣烂呈糊状，辣椒越辣越好)涂抹病患处，使其表面附着一层均匀的辣椒汁膜即可。隔7～8天再涂1次，连涂3次。治愈率达96%。
二、注重刮皮对发病重的苹果园，重刮皮就是对主干主枝中心干基部进行全面刮皮，把树皮外层刮去0.5～1毫米，一般刮粗皮、老翘皮，但不触及形成层，被刮的树皮呈青一块、黄一块的嵌合状。
三、施草木灰将有根腐病症状的苹果树冠下的土壤扒开刮去腐烂部分，晾一段时间后每株施2～5公斤草木灰并加上少许细土进行覆盖，2个月后发出新根，树势逐年恢复。
四、浸渍碱水将食用碱面和水按1：5的比例配成碱溶液。将病疤刮净，用小刷子将碱水充分涂抹在病疤上，周围超出病疤5厘米左右，使碱溶液能够充分浸渍到树皮内。然后，用塑料膜包严扎牢。10天后再进行1次，一般半年后解除塑料膜。此法治愈率在85%以上。
五、涂鲜蒜姜把蒜压烂与醋混合，以1∶1的比例混合后放置2～3天可用来涂抹刮后的病斑。用利刀刮净病疤深达木质部，并要超出病疤2～3厘米，用一块鲜姜直接擦抹病患处，隔7～10天再涂1次。
六、浸渍盐水用食盐1公斤、水40公斤，配成1：40的淡盐水，并烧开凉凉。将病疤刮净，用刷子或毛笔之类的工具将盐水抹在病疤上，以浸渍到树皮内，起到杀菌消毒作用。约2周后再涂1次。此法治愈率在80%以上。
七、喷药防除秋末冬初，叶片开始脱落时，用300～500倍施纳宁液或200倍菌清毒清液进行全树淋洗式喷雾，特别是对主干主枝要喷湿喷透，这样做一次可清除60%～70%的腐烂病。
八、涂井冈霉素我们用井冈霉素等做田间治疗苹果树腐烂病试验，在刮除病斑后涂抹1：1井冈霉素溶液1次，当年防治效果达到100%。井冈霉素可使病斑愈合速度快。而石硫合剂的防效和病斑愈合均较差。
九、施农抗120农抗120对苹果树腐烂病病菌有抑制和杀灭作用。低浓度125～250微克/毫升时抑制菌丝生长；浓度提高到1000～2000微克/毫升可杀死菌丝；浸泡病菌12小时，病菌便失去致病力。其杀菌机制是使病菌体的原生质凝聚，菌体细胞功能遭到破坏，小分子物质外渗，形成大量空泡，菌体重量剧减。经多年小区试验和大面积示范应用，证明最适浓度为250～1000微克/毫升，一年后的病斑治愈率为100%，最佳的用药方法是先刮除病斑、后涂药。刮除病斑后涂药治愈率90%，同时还起促进伤口愈合的作用。
十、敷泥防治取新鲜泥土用清水拌匀，湿润程度以手捏成泥团能黏附树皮即可。涂抹在果树病疤上，厚度3～5厘米，周围超出病疤5厘米，然后用塑料膜包紧扎牢，以防水分蒸发和泥脱落。1年后，将塑料膜和泥去除。这样，好气病菌因长期缺氧就会窒息而死。此法治愈率在90%以上。
十一、硫酸铜泥浆配制成浓度为50%的硫酸铜液加入适量的干细土，拌成糨糊状，涂抹于病部，涂抹的范围比病部稍大一些。
十二、淋涂尿液先将病疤刮净，然后蘸取人尿淋涂到病疤伤口处，周围超出病疤5厘米左右。1周后再涂抹1次。一般鲜尿效果不如陈尿，陈尿治愈率在90%～99%。
十三、涂抹黄泥在病斑上涂4～6厘米厚的黄泥，要超过病斑3～5厘米，泥要硬点，用手反复按压，使病斑和黄泥紧紧粘在一起，然后用塑料布包好，防止水分蒸发。方法简便，成本低，效果好。治愈率达100%。
十四、壮树防病1.合理负担。根据树体的生育状况和施肥水平，确定合适的结果量。2.增施肥水。要注意增施有机肥，注意增施磷肥、钾肥和微量元素肥料，同时不过多偏施氮肥。3.保叶促根。早期落叶是削弱树势的重要原因。要及时防治造成果树早期落叶的病虫害。
十五、喷腐必清腐必清为植物性生物农药，可在春季果树发芽前用80%的腐必清乳剂50倍液对全树进行淋洗式喷洒；夏季7月份喷100倍液，也可在病疤处涂80%乳剂5倍液。
十六、保护树体1.避免冻害和日烧伤。果树枝干的向阳面昼夜温差大，冬季容易遭受冻害；夏季阳面没有叶片覆盖，容易因日晒而死皮。防治冻害比较有效的措施，一是树干涂白，降低昼夜温差；二是树干捆草防冻。常用涂白剂配方是生石灰12～13公斤，加石硫合剂原液(20波美度左右)2公斤，加食盐2公斤，加清水36公斤。涂白亦可防治枝干日烧。2.保护伤口。较大的锯口要削平然后涂清漆或托布津油膏、S—921抗菌剂等保护。较大的病斑治愈后要及时进行桥接并保护。
十七、涂碘酒法先把病疤刮净，然后用医用碘酒涂在病患处，隔10天涂1次，1月见效，治愈率在93%以上。
