1.猝倒病：在幼苗未出土或刚出土时发生较多，大苗发病少。幼苗未出土发病的，胚茎和子叶腐烂；出土幼苗发病的，在幼茎基部出现水浸状、黄褐色病斑，随后，病斑缢缩变细呈线状，幼苗枯死、倒伏。在苗床上，开始是个别苗子发病，几天后向周围苗子扩展，最后引起成片苗倒。
2.立枯病：在幼苗刚出土至移栽前这段时间发病，尤以幼苗中后期发病更为常见。发病初期受害幼苗在茎基部产生暗褐色病斑，幼苗白天萎蔫，晚上和早晨可恢复，严重时病斑扩展围绕整个茎基部，致使幼苗茎基部收缩，地上部茎叶枯死，但病苗直立不倒。
3.灰霉病：主要发生在幼苗中后期，发病初期叶尖、叶缘出现淡黄褐色病斑，后扩展至整个叶片，甚至幼茎、生长点，造成整株幼苗的上端死亡。此病发生由点到片，温、湿度适宜时常常造成苗床成片苗子死亡。
4.菌核病：主要危害辣椒、甜椒、黄瓜、西瓜、甜瓜等幼苗的茎部，发病初期，病斑水渍状，扩展后易呈水腐状，引起幼苗倒伏和死亡。
5.炭疽病：发病初期子叶或叶片上产生淡褐色小圆形或椭圆形病斑，后发展为褐色至深褐色大的病斑，茎部被害，产生椭圆形条状褐色病斑。温、湿度适宜时幼苗嫩叶及生长点被害后很容易死亡。
6.沤根：是一种生理病害，通常表现是幼苗出土后长期不发新根，幼根外表皮锈褐色，逐渐腐烂，茎叶生长受到抑制，叶片逐渐发黄，不发新叶。病苗很容易从土中拔出，严重时病株萎蔫枯死。沤根主要是由于阴雨天多或遇有大雪，光照不足，苗床土温低、湿度大，幼苗吸水能力受到阻碍所致。
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