小西瓜多是设施栽培，由于大棚或温室内长期高温、高湿，加上难以避免的连作或重茬，致使许多病害日趋严重，防治日趋困难，如不采用综合有效措施，病害就不能得到控制，损失也将不可避免。
一、抓好大棚或温室消毒1.用太阳能进行空间和土壤消毒。夏、秋季大棚或温室翻地时，每亩撒施生猪、牛粪1500～2000公斤、石灰40～50公斤、干稻草（干麦秸等亦可）200～300公斤（最好用刀切成20～30厘米长），接着整畦、灌水，覆盖塑料薄膜并压实四周，后扣棚或密闭温室，经过15～20天曝晒（闷）处理，土传病害和土壤线虫等可降低90%～100%，其它病害也可减少60%～80%。2.药剂空间消毒：①定植前每立方米用硫磺4克、锯末8克混合点燃熏烟消毒24小时（熏烟时要保持温室20℃左右）；②架材和生产用具可细致喷洒1%高锰酸钾液消毒；③每亩用百菌清烟剂200～250克密闭熏烟24小时。3.土壤药剂消毒：地耕翻后，每100平方米喷洒100倍液福尔马林15升并即盖塑料薄膜，6～7天后揭膜再翻耕1次，15～20天后可栽培。
二、严格种子消毒1.把种子浸入55℃热水中并不时搅动，保持55℃水温10分钟后，再让水温逐渐降至30℃，再浸种10～12小时。2.用65℃热水烫种并不断搅拌至水温降至30℃左右，再用1000倍液高锰酸钾浸种15分钟，捞出用清水冲洗2次后，再在常温下浸种12小时，可有效预防所有种传病害。3.用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液浸种30分钟，后用清水冲洗2次，对疫病有好的预防效果。4.用75%百菌清可湿性粉剂＋40%拌种双可湿性粉剂各占0.1%浓度浸种30分钟，后用清水冲洗2次，可预防种传真菌性病害。5.用新植霉素200毫克/升浸种3小时，或者用次氯酸钠300倍液浸种30～60分钟，后用清水冲洗2次，可预防种传细菌性病害。6.用10%磷酸三钠浸种20分钟，后用清水冲洗2次，可预防种传病毒病。
三、搞好无病苗的培育1.床土消毒请参照上述“一”的内容。2.苗期猝倒病、立枯病、根腐病等的防治：①用70%代森锰锌＋25%甲霜灵可湿性粉剂（按1∶1）800倍液喷雾。②用50%福美双＋25%甲霜灵可湿性粉剂（按1∶1）混剂拌适量干细土配成毒土，均匀撒施于病苗四周，围成药圈。3.定植前7～10天喷1次“陪嫁药”。
四、细心防治好定植后的病害
1.枯萎病、蔓枯病①将70%甲基托布津可湿性粉剂＋50%福美双可湿性粉剂（按1∶1）每公斤拌细土50公斤（每亩用药量为2.5公斤），撒入定植穴（沟）内，后再定植，防效优于用药灌根；②发病初期用40%拌种双500倍液，或50%代森铵水剂1000～1500倍液，或70%土菌消700毫克/公斤溶液灌根（250毫升/株），7～10天灌1次，连灌3～4次，有好防效；③用甲基托布津原粉1份加20份面粉与适量水调成糊状，涂于茎基部。2.炭疽病可在发病初期喷洒80%炭疽福美双600倍液，或40%拌种双500倍液、或70%托布津400倍液，或25%施宝克乳油3000～4000倍液等药，防治效果都不错。3.霜霉病、绵疫病①在发病前或对中心病株尽快喷58%甲霜锰锌可湿性粉剂400～500倍液，或72.2%普力克水剂800～1000倍液；②发病初期每亩施350克45%百菌清烟剂。4.白粉病喷2%抗霉菌素水剂或2%农抗BO～10水剂200倍液，也可喷40%多硫胶悬剂800倍液。5.菌核病喷50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，或50%速克灵可湿性粉剂1500倍液。6.黑星病发病初期喷2%武夷霉素水剂150～200倍液，或75%百菌清可湿性粉剂500倍液，或70%代森锰锌可湿性粉剂400倍液；发病严重时，可用上述1～2种药灌根。7.根结线虫病①用50%锌硫磷乳油1500倍液灌根，每株200～250毫克。②定植前每亩用必速灭微粒剂5～6公斤拌50公斤细土撒施或沟施（深20厘米），定植后立即覆土并覆盖塑料薄膜，10～15天后揭膜通气，再过15～18天就可播种或定植。
