香蕉主要病虫害有真菌性叶斑病，细菌性烂茎病，根结线虫病，果指黑星病，球茎象鼻虫。至于束顶病、花叶心腐病目前尚无理想防治药剂。唯一防治方法是选择无病毒试管苗。
1、香蕉叶斑病。香蕉叶斑病是四种叶斑真菌总称。发病期5～10月，病菌由土壤传染或风雨传播，蔓延猖镢。蕉叶染病呈褐色长条斑，椭圆斑，绿枯斑，逐叶上爬枯萎衰败。染病香蕉慢抽蕾，果穗瘦，品质劣、抗寒力弱，严重减产减收。
防治方法：叶斑病发病规律是4～5月份高湿高温，叶片幼嫩病菌潜入，9～10月份北风吹来病斑一齐表现出来。蕉农误认在8～9月份才发病，此时，喷药治叶斑已经来不及了，应当提前在5月份正是茎叶旺盛无病斑时期就要喷药防治。有经验蕉农总结二句话：“无病要喷药、有病无仙丹”。这是防治叶斑病的秘诀----以防为主。喷药方法，先喷洒蕉头周围表土，再自下而上喷洒假茎及心叶以下蕉叶正、背面。特别是暴雨过后即时喷药防治。什么药剂对防治叶斑病最特效呢？目前专家还没有论证。我认为凡是杀菌剂对叶斑病都有效果，不在价格高低，只要防治方法正确，以防为主，都有效果，例如广西蕉农使用最便宜的硫磺悬剂代森锰锌、多菌灵效果良好，又十分便宜。香蕉心叶，果穗对农药十分敏感。如稻脚青、异稻瘟净、加收米、富士一号都会对香蕉产生药害，影响抽蕾，不能用于防治叶斑病。
2、香蕉黑星病。在香蕉抽蕾前后，葵叶及果指上产生许多小黑粒、手摸无粗糙感，不是花蓟马为害，是真菌性黑星病，影响果外观及价值。在抽蕾时喷多菌灵、甲霜灵等杀菌剂。注意嫩叶、果指都要喷洒，喷药后果穗套袋。
3、香蕉根结线虫病。侵害根部。黑根、根短肥、结肿瘤、线虫病症状与束顶病相似，植株矮化、黄叶或从叶、散把、叶边缘失绿，叶片呈波浪状皱曲。线虫病与束顶病区别只是束顶病叶柄有“青筋”。所以香蕉病害有真、假束顶病之说法。如何鉴别真假，一是检查叶柄有否“青筋”；二是施杀线虫剂、米乐尔、呋喃丹、克线磷、甲基异柳磷，每株撒施10～15克于蕉头表土，杀死线虫。并加强肥水管理，约15天后如有抽出新叶即是线虫病可不必挖掉。如不能再抽新叶即是束顶病。每株灌入柴油2两使蕉头烂掉再挖去病株，以防传染。
4、香蕉烂柄病。该病属细菌性病害，发病期5～6月或9～10月份。症状是叶柄腐烂，臭味，挤压流脓汁、叶柄一片片剥落呈赤膊状。防治方法：以“香蕉细菌灵”浇灌叶柄及整株假茎。注意排水防浸根，增施钾肥。
5、香蕉害虫主要是象鼻虫。蛀食假茎、叶柄、花轴、球茎，为害极大，也是台风香蕉拆断重要原因。象鼻虫每年4～5月和9～10月是成虫发生的两个高峰期。在傍晚，用巴丹、乙酰甲胺磷等杀虫剂喷洒假茎，毒杀成虫。未抽蕾株在入冬前可用呋喃丹、米乐尔、杀虫丹在“把头”处投放5～10克。
香蕉还有交脉蚜、卷叶虫、花蓟马等害虫，可用辟蚜雾、氧化乐果、敌百虫、马甲磷等杀虫、螨剂防治。在喷洒药剂防治香蕉病虫害时，注意加入0.1%洗衣粉作为粘着剂，特别注重均匀喷洒叶背。
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