菌核病是土传真菌病害，塑料棚、温室或露地黄瓜均可发病，但以塑料棚黄瓜受害重，从苗期至成株期均可被侵染。主要为害果实和茎蔓。
一、为害症状：
(1)果实染病多在残花部，先呈水浸状腐烂，并长出白色菌丝，最后菌丝上散生出黑色菌核。
(2)茎蔓染病初在近地面的茎部或主侧枝分杈处，产生褪色水浸状斑，后逐渐扩大呈淡褐色病斑。高温高湿条件下，病茎软腐，长出白色棉毛状菌丝。茎纵裂干枯，病部以上茎叶萎蔫枯死，在茎内长有黑色菌核。
(3)叶柄、叶、幼果染病初呈水浸状并迅速软腐，后长出大量白色菌丝，菌丝密集，形成黑色鼠粪状菌核。一般长在腐败了的茎基部，或烂叶、叶柄、瓜条等组织上，茎表皮纵裂，但木质部不腐败，故植株不表现萎蔫，病部以上叶、蔓凋萎枯死。
二、诊断要点：主要发生于植株茎基部以及幼花果，后期出现老鼠屎状黑色菌核。
三、菌核病综合防治要点：
1、保护地内加强通风，降低空气湿度，结合防治黄瓜其它病害，利用生态防治，在黄瓜生长期间，注意放风排湿，夜间温度下降闭棚时，不要闭的太快，减少黄瓜叶面结露。浇水后闭棚升温，当温度达32～33℃时，维持2小时，再放风，能有效的降低大棚(温室)空间湿度。另外，注意覆盖地膜，抑制菌核萌发。
2、增施磷钾肥。
3、可选药剂：咪鲜胺、福.福锌(炭疽灵)、多.福.溴菌(炭克)、多氧清水剂、易保、混杀硫、农抗120、溴菌腈(炭特灵)。如果能混入丰收一号、喷施宝，可有药肥兼收之效。
4、可用百菌清烟剂熏棚，也可以喷撒甲硫.霉威、百菌清粉尘剂、克炭疽粉尘剂，每亩1千克。
