菌根是土壤中某些真菌侵染植物根部，与其形成的菌-根共生体。包括由内囊霉科真菌中多数属、种形成的丛枝状菌根(简称AM菌根，Arhusclar mycorrhiza)、担子菌类及少数子囊菌形成的外生菌根、以及与兰科、杜鹃科植物共生的其他内生菌根和由另一些真菌形成的外-内生菌根等。与农业生产关系密切的是AM菌根真菌，它是土壤共生真菌中分布最广泛的一类真菌，至少可以与200个科的20万个种以上的植物行共生生活。虽然从发现AM菌根至今已有100多年的历史，但由于其纯培养问题尚未解决，限制了这类肥料的使用。
①AM菌根对宿主的有益功能AM菌根侵染到宿主根部形成椭圆形泡囊，还将菌丝伸延到土壤中去，从而扩大了吸收面，帮助宿主吸收磷、钾、硫、钙、锌、铁、铜等营养元素及水分，使宿主的产量增加和品种提高。最近又发现AM菌根对重金属的”解毒”功能及其他抗逆作用。
②AM菌根的生产和应用在其纯培养目前未能突破下，国内外的研究者利用各种人工培养大量的接种AM菌根的植物根，然后用这些侵染了VA菌根的植物根段和有大量活孢子的根际土为接种剂去接种作物，可以获得较好的增产和提高品质的效果。由于生产量受限制，目前主要用于名贵花卉、苗木、药材和经济作物的接种，效果稳定，应用前景良好。另外在植物组织培养快速育苗时接种AM菌根，形成AM菌根的侵染苗也是一个较好的应用途径。AM菌根的大面积应用与其纯培养的突破密切相关，应用中也会遇到与土著AM菌根竞争的问题，这些问题需要进一步研究解决。这一产品的标准和产品质量问题也需研究和探讨。
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