针对目前棉花施肥上存在的有机肥施用量少、氮肥用量偏高、前期氮肥用量过大、后期普遍缺肥以及对缺锌硼土壤不注重锌肥施用等突出问题，采取以下科学施肥方法：坚持有机肥与无机肥相结合；控制氮肥总量，调整基、追肥比例，减少前期氮肥用量，实行氮肥用量后移；磷钾肥长期恒量监控，中微量元素因缺补缺。根据播种方式，采用条施、穴施等方式做到基肥深施，施后立即盖一层土再播种，盖土深度需要在6.7厘米以上；追肥沟施或穴施覆土，覆土深度也应在6.7厘米以上；对缺硼的土壤补施硼肥。
一、有机肥施用量：每亩4000公斤左右。
二、氮磷钾施用量：每亩皮棉单产水平在100公斤以下的，亩施氮肥16公斤、磷肥7公斤、钾肥12公斤；每亩皮棉单产水平在100～150公斤的，亩施氮肥15公斤、磷肥6公斤、钾肥11公斤；每亩皮棉单产水平在150公斤以上的，亩施氮肥14公斤、磷肥5.5公斤、钾肥10公斤。
三、硼肥施用量：对缺硼的土壤，每亩基施硼肥1公斤。
在施肥比例上，基肥：亩施有机肥2000公斤，氮、钾肥总量的30％、磷肥总量的60％；花铃肥：亩施有机肥1000公斤，氮、磷、钾肥总量的20％；盖顶肥：亩施有机肥1000公斤，氮、钾肥总量的50％和磷肥总量的20％。
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