肥料的种类对甜瓜的品质好坏关系密切。一般认为含磷钾量高的饼肥、鱼肥和鸡禽粪效果最好。
瓜地常用的肥料有厩肥、堆肥、草粪、土杂肥等粗肥和人粪干、饼肥、鱼肥、骨粉等以及各种化肥。
厩肥以牛、猪粪为多，其中以猪粪为最好。堆肥、草粪则以秸秆、杂草、树叶再掺加土、水、粪稀堆闷发酵而成。西北一带的土杂肥包括炕土、墙土、硝土等，新疆瓜农在种植哈密瓜时施用硝土，可以改进果实的品质和促进早熟。
饼肥中以芝麻饼最好，其次是豆饼、花生饼、菜籽饼、棉籽饼、大麻饼、蓖麻饼等。再次，磷、钾含量较高的鱼肥、骨粉、草木灰、鸡鸭粪、鸽粪等，有经验的瓜农多喜欢使用鸽子粪，而目前更多的是把注意力放到使用鸡粪和其加工品的使用上。这些肥料施用后可以促进植株健壮生长，增强抗病能力，改进果实品质。新疆瓜农施用苦豆子、骆驼刺等绿肥盾，亦有提高果实含糖量的效果。
甜瓜栽培中化肥的合理使用
实践证明，合理使用化肥可以起增产保质的良好效果，如若使用不当将会导致品质下降。在使用化肥的过程中，必须注意掌握以下几项原则：
①必须与有机肥配合施用才能更好地发挥作用，尤其是在有机质含量低和保肥保水差的地块上更应注意到这一点。
②必须注意氮、磷、钾三要素的合理搭配，切不可偏施单一的氮素化肥。
③施用化肥的种类和数量应根据不同生育时期、植株长势以及不同栽培目的而定。幼苗期以氮、磷为主，促进根系发达；伸蔓期应以氮肥为主，促进茎叶健壮生长；结瓜期则以钾、氮为主，以改进果实品质。
④近年来复合化肥和瓜田专用化肥应用越来越多，实践证明，甜瓜上施用复合或专用化肥具有明显的增加产量和保证质量的效果，应予提倡。
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