常用的含氮肥料有氯化铵(含氯离子66.3%)，氯化钾(含氯离子47.5%)。氧元素少则有益，多则有害，所以正确施用含氯化肥，对于提高化肥施用效果有重要意义。
氯在作物营养平衡中的主要作用是参与光合作用，调节植物细胞渗透压，并影响作物对氮、磷、钾、钙、镁和硅的吸收，增强作物对病虫害的抵抗能力，调节气孔运动。氯能促进碳水化合物的新陈代谢，加速作物茎和叶组织的发育。氯根对土壤硝化细菌有抑制作用，能延缓铵态氮向硝态氮的转化，保持有较多量的铵离子吸附在土壤胶体上，可使铵离子较多地保存在土壤中不流失，有利于氮的保蓄。
氯离子在土壤中的转化主要有：在酸性土壤中，氯离子与氢离子结合生成盐酸，能增强土壤的酸度，在中性和石灰性土壤里，残留的氯离子与钙离子结合生成溶解度较大的氯化钙。所以，长期单独施用氯化铵、氯化钾等生理酸性肥料，一方面会引起土壤变酸，使土壤有益微生物活动受影响；另一方面，肥料中副成分能与土壤钙结合，生成氯化钙。氯化钙溶解度大，能随水流失，而钙是形成土壤结构不可缺少的元素，钙盐流失过多，会破坏土壤结构造成板结。
1、因作物施用含氯化肥
根据全国对主要作物的耐氯临界值试验，综合产量和产品品质因素，将作物耐氯程度分为强耐氯作物、中等耐氯作物和弱耐氯作物3类。
(1)强耐氯作物 土壤氧浓度达到600-800mg/kg，相当于每公顷每季施氯量1350-1800kg时，不影响产量和品质的作物有水稻、麦类、玉米、高梁、谷子、棉花、红麻、萝卜、西红柿、甜菜、茄子和果树中的猕猴桃、香蕉、桃树等。
(2)中等耐氯作物 土壤氯浓度300-600mg/kg，相当于每公顷每季施氯量675-1350kg时，不影响产量和品质的作物有亚麻、大豆、菜花、菠菜、蚕豆、豌豆、草莓、花生、苹果、山楂、甘蔗等。
(3)弱耐氯作物 土壤中氯浓度<300mg/kg，相当于每公顷每季施氯量675kg时，不影响产量和品质的作物有辣椒、大白菜、马铃薯、莴苣、油菜、烟草、甘薯等。
强耐氯作物施用含氯化肥不影响作物的产量和品质，根据质量检测结果，氯对水稻、小麦、玉米等作物籽粒中蛋白质和淀粉含量，对油菜、大豆的粗蛋白质和脂肪含量，对甘蔗、甜菜的含糖量以及蔬菜中维生素C和糖分含量均无不良影响。同时蔬菜中施用含氯化肥还可降低蔬菜中硝态氮含量。
2因地区施用含氯化肥
含氯化肥应重点用在降雨量较多的地区或季节以及灌溉条件的地方。在多雨地区或季节，施用含氯化肥后氯离子可随水淋失，因而随肥料带到土壤中的氯离子不会因积累而引起“氯害”。在盐渍化土壤中，因氯离子含量较高应少用或不用含氯化肥。
3含氯化肥应早施深施
氯离子能抑制种子萌芽，降低发芽率和出苗率。所以含氯化肥应早施、深施，以便土壤吸附，氯离子被淋失，降低作物根层受氯害。作物根系大多集中分布在10-25cm土层内，因此，含氯化肥作基肥层施、条施、穴施应在8-12cm以下。
4含氯化肥制成复混肥施用
用含氯化肥与尿素、磷铵、重钙或过磷酸钙、钙镁磷肥、硫酸钾、硝酸钾等肥料加工制成复混肥，不仅可减少氯离子的危害，而且氮、磷、钾配合施用，可起到相得益彰的效果。
氯离子的积累与年降雨量、土壤质地和种植制度关系密切，在干旱少雨地区施用含氯化肥，氯离子在土壤中积累较多，残留量高达30%-80%；在南方多雨地区，每公顷每季施氯量300-1450kg，5年中土壤中的氯离子也无明显增加。据研究，在降雨量为1500mm条件下，被认为是“忌氯作物”的甘蔗、甘薯、马铃薯，每公顷施氯量332-135kg，对产量和质量并无不良影响。
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