一、刺激生理代谢。腐殖酸含有多种活性功能基因，可增强作物体内过氧化氢酶，多酚氧化酶的活性，刺激生理代谢，促进生长发育。如腐殖酸能促使种子提早发芽，出苗率高，在低温下尤为显著；能刺激根系极端分生组织细胞的分裂与增长，使幼苗发根快，此生根多，根量增加，根系伸长，使作物吸收水分、养分能力增加。因此，养分供应充足，作物茎快健壮，枝叶繁茂，光合作用增强，加速养分向子实体转移，促进国是提前着色成熟。
二、改变化肥特性
腐殖酸含有羧基，酚羟基等官能团，有较强的离子交换和吸附能力，能使碳铵减少铵态氮的损失，提高氮肥的利用率。经氧化降解的硝基腐殖酸，可抑制尿酶活动，减少尿素挥发。降解的硝基腐殖酸增加磷在土壤中移动的距离，抑制土壤对水溶性磷的固定，使速效磷转化为迟效磷，促进根系对磷的吸收。腐殖酸官能团可以吸收存储钾离子，使钾肥缓慢分解，增加钾的是放亮，提高速效钾的含量。腐殖酸与难溶性微量元素可以发生鳌合反应，生成溶解性好可被作物吸收的腐殖酸微量元素鳌合物，从而有利于根系和叶面吸收微量元素。
三、改良土壤结构。
腐殖酸可以促进土壤团粒结构的形成，调节土壤PH值，调节土壤水、肥、气、热状况，提高土壤交换容量，达到酸碱平衡，提高土壤保水保肥能力，促进土壤微生物的活动，使好气性的细菌、放线菌、纤维素分解菌的数量增加，加速有机物质的分解转化，促进营养元素释放，便于作物吸收营养。
四、增强抗逆特性。
腐殖酸嫩减少植物叶片七孔张开强度，减少叶面蒸腾，从而降低好水量，使植株体内水分状况得到改善，保证作物在干旱条件下正常生长发育，增强抗旱性。腐殖酸多为两性胶体，表面活性大，对真菌有抑制作用，可增强作物坑寒性，易被细胞膜媳妇，改变细胞膜参透性，促进无机养分的吸收，防止腐烂病、根腐病，减少病虫害。
五、改善子实质量。
腐殖酸可以与微量元素形成络合物或鳌合物，增加微量元素从根部向叶部或其它部位运转的数量，调节常量元素与微量元素的比例和平衡状况，加强酶对糖分、淀粉、蛋白质、脂肪及各种维生素的合成运转。可促进酶的活性，使多糖转化为可溶性单糖，使淀粉、蛋白质、脂肪物质的合成积累增加，加速各种代谢的初级产物从茎叶或根细想国事、种子运转，使果实丰满、厚实。
