1．适当调配基料的pH值。平菇、鸡腿菇等原种的基料，可参考下述基本配方：棉籽壳95千克、麦麸5千克、过磷酸钙2千克、石灰粉2—3千克，尿素0.3千克，水150—160千克。平菇原种可在拌料后随即装瓶，鸡腿菇基料应堆放发酵5天左右再装瓶，因此可适量增加石灰粉用量。但进行装瓶时基料应调pH值至8，经过灭菌后，pH可降至7—7.5，正好适合菌丝生长。
2．掌握合适的含水率。生产中一般应掌握料水比在1∶1.50—1.60之间，但如经堆放发酵处理时，可适量增加用水量，以补充发酵过程散失的水分。生产中大多采用手握法来测水分，可根据经验判断。但基料则无法测出水分，应当根据加水量和水分的流失以及补充情况灵活掌握，备有水分测定设备当然更好。
3．及时进行灭菌处理，以杀死料内微生物。掌握好装瓶（袋）的操作与灭菌处理间的时间距离，可有效地防止基料酸败。一般要求是：装瓶时应集中人力，最好使用机械操作，在离结束装瓶前约1小时，将灭菌锅进行加温，使之产生蒸气，灭菌室内温度达到80℃左右。此后一边继续装瓶，一边装锅，两项工作基本同步结束，加大火力，使瓶内温度尽快达到规定的100℃，此后小火维持沸腾即可。使用高压灭菌设备时，也应使灭菌室预热，以避免基料在达到规定温度前产生酸败。常压灭菌应维持6—12小时，高压灭菌压力达0.15Mpa后维持2小时。
