1．采收、干制
在正常情况下，从原基出现到菌盖成熟需要20天左右，当菌盖充分展开，释放大量孢子，边缘白色消失，增厚不明显，菌盖颜色赤红（红芝），色泽均匀，这时即可采收。
采收后的于实体及时切去菌柄基部粘附的培养料，在太阳光下晒干，或置于烤房内烘干，温度控制在55-65℃，烘至灵芝含水量12%左右。新鲜灵芝的含水量通常为63%，折干率一般为40%-45%。晒干或烘干的灵芝装入双层袋（一层塑料袋，一层编织袋），置干燥的仓库内保存，并随时检查，防霉、防蛀。
2．深加工
灵芝的干制品可根据不同用途制成各种新产品。供药用的可制成糖浆、片剂、针剂、冲剂、酒剂等。供保健食品用的可制成各种饮料、口服液、袋泡茶等。供化妆品用的可制成洗发香波，美容霜等。供观赏用的可制成各种盆景工艺。深加工需要一定配套设备和技术，以下只介绍一些简单易行的有关药用和观赏用的再加工。
(1)供药用的制剂
现代医学研究证明，灵芝的药用价值有以下几方面：
①能抵抗血栓的形成（能溶解新形成的血栓和老化的血栓）；
②使血压正常；
③改善高血脂症；
④防止动脉硬化；
⑤使中枢神经等躯体机能保持平衡；
⑥提高机体免疫力；
⑦有镇痛作用，可以减轻癌症或其它疾病带来的疼痛；
⑧延缓衰老。
在使用上最简便的方法就是每天用10克灵芝堡茶饮，坚持2个月，可收到良好的效果。但作为治疗各种疾病。则必需作成各种制剂，包括糖浆、片剂、针剂等。下面介绍一种片剂的简单制法：
将灵芝及灵芝根皮除去杂质，洗净，水煎2次，每次3小时，取汁放置沉淀6-8小时，过滤，滤液浓缩至比重1.26-1.28（波美表90-95℃热测）的浸膏，加入适量辅料拌和均匀，干燥后制成颗粒再行压片，包上糖衣即成。要求制成每片相当于含生药1克的糖衣片。此片剂适用于神经衰弱，也可作为冠心病和慢性气管炎的辅助治疗。用法是每日3次，每次3片，饭后服，以10天为一疗程，一般服用二个疗程。
(2)供观赏的盆景工艺
①造型栽培
根据灵芝的生物学特性，通过改变光、温、水、气等条件，可以达到抑长、助长和造型的效果。如在通气不良（C02浓度达0.1%）、低温（＜22℃）条件下培养，则只长菌柄不形成菌盖，菌柄分叉成鹿角状。如果通气良好，温度在25-28℃下，则伸长的菌柄又会很快长出菌盖，二层菌盖的造型就是根据这种特性反复改变培养条件育成的。又如灵芝子实体具有较强的向光性，采用四面遮光，可使菌柄和茵盖呈垂直方向生长，如果采用单侧光则可使菌柄和菌盖朝有光的方向生长，从而可以根据需要达到各种造型。
②盆景配置
将造型栽培的灵芝，经人工稍加整修、点缀，并配以山石、砂粒、树桩，以及晒干的苔藓、枝状地衣、卷柏等不易碎烂的植物，则可制成形态各异，色彩艳丽的各种灵芝盆景。盆景配制时要注意以下几方面：
第一，灵芝素材和陶瓷盆的颜色、布局要协调、美观。加以赤芝、松杉灵芝作盆景素材，可选用棕色、紫砂色的陶瓷盆，以显出古朴典雅，色彩协调的效果。如以紫芝、黑灵芝作素材，则可选用白色的瓷盆，以强烈的对比色，可以突出紫芝等优美的色彩和姿态。
第二，灵芝素材和配件在盆中要固定牢固。为便于长期保存，可用乳胶、玻璃胶或石膏将灵芝素材及配件固定在盆中，也可用石英砂颗粒或砂粒作填充物将灵芝固定在盆中，此外也可用细铁丝交织成网，将灵芝插在网眼中，两者一起固定在盆中。许多菌柄很短甚至无柄的灵芝，如树舌灵芝、白皮壳树舌灵芝、薄树芝等具有大型的菌盖，可将基部削平粘结于浅盆中。
