百合种类较多，繁殖时可根据不同种类，不同时间，采取适宜的措施。常见的有播种、分小鳞茎、鳞片扦插和分株芽等4种方法。
播种法繁殖播种属有性繁殖，主要在育种上应用。种子采后即播，也可贮藏到翌年春天播种，播后约20～30天发芽。幼苗期要适当遮阳，并加强水肥管理，到秋天就可形成小鳞茎。播种实生苗因种类的不同，开花时间也不同，像麝香百合一年就可开花，有的3年开花，也有的需培养多年才能开花。
分植小鳞茎繁殖1株或几株，可采用此法。母株在地下茎节上形成小鳞茎，有时在母株球的基部也能形成小鳞茎。在9～10月收获百合时，可把这些小鳞茎分离下来，另行栽植或沙藏至第二年春再种。栽时宜深，均经20天即可发芽。培养到第三年9～10月，即可长成大鳞茎而培育成大植株。此法繁殖量小，只适宜家庭盆栽繁殖。
分珠芽法分珠芽法繁殖，仅适用于少数品种。如卷丹、黄铁炮等百合，多用此法。将地上茎叶腋处形成的小鳞茎（又称“珠芽”，在夏季殊芽已充分长大，但尚未脱落时）取下来培养。当年可形成小鳞茎，翌年春萌发出土，秋天再掘起分栽，3年后多数可开花。为促使多生小珠芽供繁殖用，可在植株开花后，将地上茎压倒并浅浅埋土，将地上茎分成每段带3～4片叶的小段，浅埋茎节于湿沙中，则叶腋间均可长出小珠芽。
鳞片扦插法秋天挖出鳞茎，将老鳞上充实、肥厚的鳞片逐个分掰下来，每个鳞片的基部应带有一小部分茎盘，稍阴干。然后扦插于盛好河沙（或蛭石）的花盆或浅木箱中，让鳞片的2／3插入基质，保持基质一定湿度，在20℃左右条件下，约1个半月，鳞片伤口处即生根。冬季湿度宜保持18℃左右，河沙不要过湿。培养到次年春季，鳞片即可长出小鳞茎，将它们分上来，栽入盆中，加以精心管理，培养3年左右即可开花。
