危害荷花的害虫主要有蚜虫类和夜蛾类两类。这两类害虫有明显的季节性，前者在早春，后者在中秋。掌握其繁殖活动规律，做到提早防治，则效果会好一些。蚜虫类家庭盆栽荷花数量少，在蚜虫初出现时，可用手直接捻除或用刷子刷除，也可用洗衣粉加水千倍液用小喷雾器喷雾触杀。花卉市场上出售的“家庭专用杀蚜剂”使用方便，效果好。
盆栽数量多的荷花园可用敌敌畏加水2000倍或20％杀灭菊酯乳油2000倍液喷雾触杀。为增加药液在荷叶上的附着力，可加入极少量的洗衣粉。因各厂家生产的敌敌畏、洗衣粉的成分和含量不同，应先进行试验，再大面积使用，掌握最佳喷药时间和方法，避免产生药害。
蚜虫抗逆能力差，大量繁殖与大量死亡相对应。在烈日、大风、暴雨和天敌的干扰下，很快会销声匿迹，一般不会对盆栽荷花造成大的危害。
夜蛾类夜蛾在幼虫期时，可采用人工捕捉和药物触杀相结合的方法灭除。用敌百虫晶与敌敌畏混合后加水1600至2000倍喷雾，触杀和熏杀双管齐下，效果良好。
夜蛾类成虫昼伏夜出，有很强的趋光性。夜晚用电击式黑光灯诱杀，灯下面放一个加有煤油的水盆，有效半径可达50米，每只灯每夜可诱杀夜蛾类等害虫上百只，效果非常好。
水中害虫夏季盆内水中易滋生小红虫、水蚯蚓等，危害荷花浮叶和根系。家庭盆荷每盆加半片敌百虫即可消灭。盆栽荷花园结合施肥，把含量3％的呋喃丹与颗粒状肥料混匀后施入盆内，即可防治。呋喃丹又叫沙子药，每667亩可混药1至2千克，施肥时要戴防护手套。
