现在肥料市场上尿素有大颗粒和小颗粒之分，一般来说，将颗粒直径大于2毫米的尿素称为大颗粒尿素。颗粒大小的差异，源自于生产中采用的造粒工艺与设备。有用成分均是水溶态速效性尿素分子，含氮量均是46%，大颗粒和小颗粒尿素哪种肥效更好呢？
大颗粒尿素相对小颗粒尿素粉尘含量低，抗压强度较高，流动性好，可散装运送，不易破碎和结块，适合于机械化施肥。大颗粒尿素施入土壤后溶解速度稍慢，在水田尤其是水稻栽培中利用可沉入较深的土壤层，减少挥发损失，同时大颗粒尿素缩二脲含量低，这对作物有利。不过需要小心的是，水稻上施用大颗粒尿素可能会加强硝酸盐淋洗的风险。
小颗粒尿素的表面积大，施入后与水和土壤的接触面大，溶解和释放的速度要稍快一点。大颗粒尿素在土壤中的溶解和释放稍慢一点。这一点差异反映在施用对策上，即作追肥时，小颗粒尿素的肥效要稍快于大颗粒尿素的肥效。而从损失的角度来比较，大颗粒尿素的损失要小于小颗粒尿素的损失。总的来说，二者肥效的快慢之差是很小量的。对于作物的吸取使用来说，尿素均是分子态氮，它们直接被作物汲取的数量不多，要在土壤中转化成铵态氮后才能够大量吸取。所以尿素无论颗粒大小，作追肥施用时都要比碳铵提前几天。其它，大颗粒尿素的粒径与磷酸二铵的颗粒粒径相近，所以大颗粒尿素能够与磷酸二铵掺混作底肥施用，而最好不用大颗粒尿素作追肥。
