调制好的干草应及时妥善收藏保存，合理贮藏干草，是调制干草过程中的一个重要环节。青干草的贮藏方法是否合理，对青干草品质影响很大。若青干草含水量较高，营养物质易发生分解和破坏，严重时会引起干草发酵、发热、发霉，使青干草变质，失去原有的色泽，并有不良气味，饲用价值会大大降低。收藏方法可因具体情况和需要而定，不论采用什么方法贮藏，都应尽量缩小与空气的接触面，减少日晒雨淋等影响。
1．散干草的贮藏
(1)露天堆垛这是一种最经济、较省事的贮存青干草的方法。选择离畜舍较近、平坦、干燥、易排水、不易积水的地方，做成高出地面的平台，台上铺上树枝、石块或作物秸秆约30厘米左右厚，作为防潮底垫，四周挖好排水沟，堆成圆形或长方形草堆。长方形草堆，一般高6-10米，宽4-5米；圆形草堆，底部直径3-4米，高5-6米。堆垛时，第一层先从外向里堆，使里边的一排压住外面的稍部。如此逐排向内堆排，成为外部稍低，中间隆起的弧形。每层30-60厘米厚，直至堆成封顶。封顶用绳索纵横交错系紧。堆垛时应尽量压紧，加大密度，缩小与外界环境的接触面，垛顶用薄膜封项，防止日晒漏雨，以减少损失。为了防止自燃，上垛的干草含水量一定要在15％以下。堆大垛时，为了避免垛中产生的热量难以散发，应在堆垛时每隔50～60厘米垫放一层硬秸秆或树枝，以便于散热。
(2)草棚堆藏气候湿润或条件较好的牧场应建造简易的干草棚或青干草专用贮存仓库，避免日晒、雨淋。堆草方法与露天堆垛基本相同，要注意干草与地面、棚项保持一定距离，便于通风散热。也可利用空房或屋前屋后能遮雨地方贮藏。
2．压捆青干草的贮藏
散干草体积大，贮运不方便，为了便于贮运，使损失减至最低限度并保持干草的优良品质，生产中常把青干草压缩成长方形或圆形的草捆，然后一层一层叠放贮藏。草捆垛的大小，可根据贮存场地加以确定，一般长20米，宽5米，高18-20层干草捆，每层应有0．3立方米的通风道，其数目根据青干草含水量与草捆垛的大小而定。
3．半干草的贮藏
(1)氨水处理牧草适时收割后，在田间经短期晾晒，当含水量为35％-40％时即打捆贮存，可逐捆注入浓度为25％的氨水，然后堆垛用塑料膜覆盖密封。氨水用量是青干草重量的1％-3％，处理时间应根据温度不同而异。一般在25~C左右时，至少处理21天以上。用氨水处理半干豆科牧草，可减少营养物质的损失。与通风干燥相比粗蛋白质含量提高8％-10％，胡萝卜素提高30％，干草的消化率提高约10％。
(2)有机酸防腐剂处理有机酸能有效地防止高水分(>30％)青干草发霉变质，并可减少贮存过程中的营养损失。生产实践中常用于打捆干草。豆科干草含水量20％-25％时，用0．5％的丙酸；含水量为25％-30％时，用1％的丙酸喷洒效果较好。
青干草在贮存中应注意控制含水量在17％以下；并注意通风和防雨。这是由于青干草仍含有较高水分，发生于青干草调制过程中的各种变化并未完全停止。如果不注意通风，周围环境湿度大或漏雨，致使干草水分升高，则酶和微生物共同作用会导致青干草内温度升高，当温度达72℃以上时，会出现化学氧化，导致进一步产热，热量的累积最后会引起青干草自燃。因此，要定期检查维护，发现漏缝、温度升高，应及时采取措施加以维护。
干草经过长期贮存后，干物质的含量及消化率降低，胡萝卜素被破坏，草香味消失，适口性也差，营养价值下降。因此，过长时间的贮存或是隔年贮藏的方法是不适宜的。
