农谚说：“苗好五成收”。要使辣椒优质、抗病、丰产，培育出健壮的秧苗是首要关键，这也是辣椒生产获得高产稳产的关键环节，壮苗的标准是：茎杆粗壮，根系发达，叶片肥厚，叶色（深）绿，苗高15--20厘米，现蕾，无病虫害。本阶段管理工作的重点是保证良好的光照条件使幼苗生长健壮，适当降低床温，防止徒长，保持适宜温度和养分以利幼苗生长，并及时预防和防治病虫害。
1、备好营养土 苗床宜选择地势高燥，排水良好，土壤疏松、肥沃，未种过茄果类作物的无病田块。营养土的配制如下：肥活的菜园土50％，充分腐熟的厩肥（人、猪、牛粪）40%。草木灰10％，每立方米营养土拌入已捣碎的茄果类蔬菜专用肥2克，充分混匀。
2、种子温汤处理 将种子置入50℃--55℃温水中浸泡15--30分钟，再在30℃温水中浸泡3--4个小时，然后将种子冲洗干净待种子露白后播种。
3、播种 播前床面应整平，浇足底水(水渗入床土深10厘米），播种时力求均匀。每平方米播种6--8克，每亩约播种50克左右。播后盖上盖籽土，厚度为0．5--1厘米。
4、温、光、水控制 种子出苗前苗床应保持较高温度，白天30℃左右，晚20℃左右。苗出齐后白天25℃左右，晚上18℃左右。出苗期间苗床要经常保持湿润。若发现床表局部区域土壤发白，则可采用细孔喷壶来回轻浇补水，浇水应早晚三凉(天凉、地凉、水凉)时进行。并根据天气变化，及时覆盖或调整覆盖物。苗齐后要控制好水分和光照，防止徒长。
5、间苗 播后7--10天，幼苗子叶平展时进行间苗。拔除过分拥挤的幼苗和生长不良的弱苗。
6、分苗 幼苗二叶一心时就可以分苗。分苗前3--4天，加强放风，降低温度，提高幼苗的抗逆性，促进分苗后加速缩短缓苗时间。分苗时苗距7--8厘米，可直接分在苗床或营养钵内，边移边浇透水，以利早活棵。
7、分苗后管理 分苗时一次浇足水，可保持5--7天，一般不用再浇水。之后幼苗开始发根，及时浇一次水，水量宜小，及时浅中耕，疏松土壤利于增温透气保墒，但不能伤根。防止徒长。定植前10--15天控制水分，降温炼苗。
8、苗期病虫害及防治 辣椒苗期病虫害有猝倒病、立枯病、灰霉病、沤根及小地老虎危害等。对病虫害的防治应以防为主，田间综合管理和药剂防治相结合为原则。
防治措施主要有：①种子消毒。②床土消毒。③适量稀播，及时间苗、分苗。④及时通风透光，降低苗床湿度，控制浇水，保持床土干燥。⑤药剂防治，可用80％代森锌700--800倍液或百菌清800倍液防治。
