一、控温控湿法。将适时采摘的辣椒轻轻放入专用鲜贮塑料袋或硅窗袋中，每5～10公斤装一袋。同时应注意避免碰倒辣椒。入库前应在室温下预冷1～2天，将开始转红、有机械损伤的辣椒和嫩椒挑出，后放入阴凉的室内。堆放时不宜过高过重以防压坏下面的辣椒，最好应搭架分层分格堆放。同时应使室内的温度控制在5～10℃，相对湿度控制在85%左右，尤其应注意在春天时，室内的温度不能超过8℃，相对湿度不应大于80%。期间做好贮藏检查管理工作，及时挑选出烂果。
二、砂藏法。首先应选择比较阴凉的地方，挖一宽1米，深1米，长度不限的沟。并将挖出的土培垒在沟的四周，使沟的总深度在1.3米左右。并在沟底铺一层3厘米厚的选净了的潮湿细砂，后摆一层辣椒，撒一层细砂将辣椒盖住，共摆5～6层。再在上面盖约6厘米厚的潮湿细砂，这样使沟内保持80%左右的相对湿度。最后在沟顶横放竹竿，在竹竿上放草垫。最初在白天盖上草垫，晚上揭去草垫。但随着沟内温度的下降，晚上可不再揭草垫，且还要逐渐加厚草垫，以使沟内的温度保持在5～8℃左右。每隔15天翻动一次，拣选出不宜再继续贮藏的辣椒上市销售或自己食用。
三、窖内盖藏。把选好的辣椒装入垫有纸的竹筐中，放入窖内，后用湿草席围在竹筐的四周和盖在筐顶。草席干后要及时喷水，使窖内的相对湿度保持在80%左右，温度保持在5～8℃。这与砂藏法的要求相同。
用上述几种方法，可使夏收辣椒贮藏保鲜2个多月左右，秋种冬收的辣椒可贮藏更长的时间，达3个多月。
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