种植三年以上的大棚或日光温室土传病害日趋严重，真菌性病害、细菌性病、根结线虫病、土壤板结、酸化，有的植株死秧后查不出病因，实际是土壤盐渍化造成的盐害。为了觧决这些问题，利用石灰氮，在夏季设施休闲时进行土壤消毒，利用夏日高温+石灰氮+秸秆进行土壤消毒。此方法已被山东省地方标准法写入“日光温室无公害蔬菜生产技术操作规程”。
具体方法：在地表撒上碎稻草或麦秸（1平方米撒1公斤）与石灰氮（l平方米施0.1公斤），与土壤充分混合（用旋耕犁旋二遍），起垄（垄宽60厘米，高40厘米），并盖上地膜，沟内灌水，将设施、大棚密闭。白天地表温度可达70℃，20厘米深层土温度在40～50℃，持续20～30天，就可起到土壤消毒和降盐的作用。
对土壤耕层不足20厘米的地块，土壤扳结盐渍化较重的大棚内，或根结线虫发生较普遍的棚内，在进行消毒时必须先进行土壤深翻30～40厘米，然后撒上石灰氮、秸秆（麦秸或玉米秸、或鸭圈粪、喂牛剩于的草渣、鲜瓜豆类秧蔓粉碎）后，旋耕二遍，再起垄、盖地膜（封闭越严越好）、灌水、密闭大棚，进行高温闷蒸。消毒时间可从6月中旬至8月底。温度越高杀虫、灭菌效果越好。
对于病、虫害不是太严重，或只有死秧而没有根结线虫的棚，或上一年进行过严格消毒的棚室可采取简易法，沟垄交替免耕法：将原来的走道深挖宽30～40厘米，沟深25～30厘米，就地将蔬菜秧（包括病株残体）鲜秧蔓2000～3000公斤/亩，或其它秸秆（干秸秆600～1000公斤）等，与有机物同石灰氮（每50公斤/亩）和下茬作物用的有机肥一齐施入沟内，边撒边与垄背土同时回填，整平后再撒一遍石灰氮（每15公斤/亩），然后将取原垄背土覆盖在上面，形成新的垄背，原来的背变成沟。盖地膜、灌水、闷棚20天左右。要注意棚膜清洁，保持良好的透光性，提高消毒效果。揭膜晾5～7天，根据茬口可直接种植下茬作物（丝瓜、豆角、耐热白菜等），若种植夏秋茬作物不需要施用其它肥料可直接种植。若在8、9月份消毒时，最好用新棚膜透光性好，消毒效果明显。
另外在育苗时要杜绝病原菌侵染，要搞好苗床土消毒，或无土育苗。床土消毒采用石灰氮，每公斤消毒床土1立方米，消毒剂与土掺均，堆积，用膜薄盖严闷7～10天，稍晾晒后就可装营养钵育苗了。定植时结合施用生物菌肥，或用克菌康、OS-施特灵进行灌根或喷施，促进根系生长效果更好。若根结线虫较普遍的地区在定植时灌一遍阿维菌素，这样会杜绝在移栽操作过程中使幼苗再次感染，效果更好。
注意：在施用石灰氮时应戴口罩，穿工作服，远离家畜生活区，24小时内不要饮用含酒精的饮料，以免引胸闷憋气等不良化学反应。如有中毒或误服，不要引吐，可以多喝水。如接触皮肤，脱掉污染衣服，清洗皮肤，误入眼内睁眼用大量水冲洗，或尽快就医。
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