枸杞根腐病发生普遍，危害严重，因病死亡植株每年在3％-5％，给枸杞生产造成很大损失。
据宁夏农林科学院鲁占魁等人研究，根腐病症状有以下两种类型：
(1）根朽型。根或根颈部发生不同程度腐朽、剥落现象，茎秆维管束变褐色，潮湿时在病部长出白色或粉红色霉层。它又可分小叶型和黄化型两种。
①小叶型：春季展叶时间晚，叶小、枝条矮化、花蕾和果实瘦小，常落蕾，严重时全株枯死。
②黄化型：叶片黄化，有萎蔫和不萎蔫现象，常大量落叶，严重对全株枯死，也有落叶后又萌发新叶，反复多次后枯死。
(2)腐烂型。根颈或枝秆的皮层变褐色或黑色腐烂，维管束变为褐色。叶尖开始时黄色，逐渐枯焦，向上反卷，当腐烂皮层环绕树干时，病部以上叶全脱落，树干枯死，有的则是叶片突然萎蔫枯死，枯叶仍挂在树上。这种现象多发生在7―8月份的高温季节。
上述各种类型，也常表现为半边树冠发病半边枯萎或仅一枝条发病和枯萎。有的树干病死，而在树根颈部又长出新的蘖生苗。
病原菌随存活病株越冬，也可随表土和土中的病株残体及病果种子越冬和传播。病菌从伤口或穿过组织皮层直接入侵到植物组织内部，引起发病。不同的病原菌和不同的浸染方式，其病害的潜育期也各不相同。在20℃条件下，尖孢镰刀菌在寄主伤口的条件下致病潜育期3天，而未受伤时为19天，茄类镰刀菌依次为5天和19天；同色镰刀菌在寄主创伤条件下致病潜育期5天。田间积水是增加发病率的重要原因。通气性差的土壤比通气性好的沙壤土增加9％-22.5％；中耕作业造成根损伤有利于病原菌的入侵。
防治的方法是，改善耕作条件，改平作为培土垄作，减少枸杞根际积水，避免耕作时伤根；用45％代森铵500倍稀释液灌根，每株用10―15千克药水。
