在西瓜生产中，尽管研制的新品种不断出现，但由于多种原因，抗病性强、感病率低的品种却为数不多，因而及时预防和防治病虫害在西瓜生产的全过程中至关重要。
1、催芽阶段 于浸种前1天将种子放在弱光下晒2～3小时。浸种时先用清水浸泡4小时，然后用40%福尔马林100倍液浸30分钟，或用50%代森铵500倍液浸1小时，或用温激发浸种，以消除种壳上附着的病菌。
2、苗床的要求 床土应充分腐熟，未腐熟的应进行消毒。其方法是：用40%的福尔马林100倍液喷洒床土并搅拌均匀，每方床土需药液30克。然后用薄膜覆盖闷蒸2～3天，闷蒸后揭开薄膜，使药报导散尽备用。在摆钵前再将床土每平方米撒10～15克呋喃丹，以防地下害虫及蚯蚓钻钵。为控制苗期病虫害发生，可用500倍液的溃疡灵或50%多营业税灵将苗床均匀喷洒1遍，喷后盖1层地膜，然后搭小拱棚。
3、营养土的要求 一般用未种过瓜类作物的肥沃田土5份，充分 腐熟的猪、牛、羊粪3份，腐熟的土杂肥2份捣碎过筛，用50%辛硫磷1000倍液和50%多菌灵500倍液，将过筛的营养土均匀地喷洒1遍，然后聚成堆，外覆严膜以杀虫灭菌。为减轻拌药的劳动量，配制营养土内可不加药剂，但盖土一定要用200：1的50%多菌灵等药土盖种，从而有效防治苗期猝倒病。
4、大田防治 病害以西瓜枯萎病、炭疽病、疫病为主，虫害以红蜘蛛、黄守瓜、蚜虫等为主。首先，要搞好农业防治，做到合理排涝，科学施肥，及时整枝打杈，摘除病蔓；其次要及时进行药剂防治，可用65%可杀得600倍液或75%百菌清800倍液加枯萎灵50克与杀虫剂克虫威2000倍液混用，每7～10天预防2次，连防2～3次。
